Diff of the two buildlogs: -- --- b1/build.log 2023-04-09 15:39:31.649733486 +0000 +++ b2/build.log 2023-04-09 15:41:37.133550066 +0000 @@ -1,6 +1,6 @@ I: pbuilder: network access will be disabled during build -I: Current time: Sun Apr 9 03:36:21 -12 2023 -I: pbuilder-time-stamp: 1681054581 +I: Current time: Sun May 12 12:02:34 +14 2024 +I: pbuilder-time-stamp: 1715464954 I: Building the build Environment I: extracting base tarball [/var/cache/pbuilder/bookworm-reproducible-base.tgz] I: copying local configuration @@ -16,7 +16,7 @@ I: copying [./libbpp-popgen_2.4.1.orig.tar.gz] I: copying [./libbpp-popgen_2.4.1-8.debian.tar.xz] I: Extracting source -gpgv: Signature made Sat Nov 26 09:16:55 2022 -12 +gpgv: Signature made Sun Nov 27 11:16:55 2022 +14 gpgv: using RSA key F1F007320A035541F0A663CA578A0494D1C646D1 gpgv: issuer "tille@debian.org" gpgv: Can't check signature: No public key @@ -28,11 +28,20 @@ dpkg-source: info: applying unforce-cxxflags.patch I: Not using root during the build. I: Installing the build-deps -I: user script /srv/workspace/pbuilder/636/tmp/hooks/D02_print_environment starting +I: user script /srv/workspace/pbuilder/16887/tmp/hooks/D01_modify_environment starting +debug: Running on codethink9-arm64. +I: Changing host+domainname to test build reproducibility +I: Adding a custom variable just for the fun of it... +I: Changing /bin/sh to bash +lrwxrwxrwx 1 root root 4 Jan 6 2023 /bin/sh -> dash +I: Setting pbuilder2's login shell to /bin/bash +I: Setting pbuilder2's GECOS to second user,second room,second work-phone,second home-phone,second other +I: user script /srv/workspace/pbuilder/16887/tmp/hooks/D01_modify_environment finished +I: user script /srv/workspace/pbuilder/16887/tmp/hooks/D02_print_environment starting I: set BUILDDIR='/build' - BUILDUSERGECOS='first user,first room,first work-phone,first home-phone,first other' - BUILDUSERNAME='pbuilder1' + BUILDUSERGECOS='second user,second room,second work-phone,second home-phone,second other' + BUILDUSERNAME='pbuilder2' BUILD_ARCH='arm64' DEBIAN_FRONTEND='noninteractive' DEB_BUILD_OPTIONS='buildinfo=+all reproducible=+all parallel=8' @@ -42,38 +51,38 @@ IFS=' ' LANG='C' - LANGUAGE='en_US:en' + LANGUAGE='nl_BE:nl' LC_ALL='C' MAIL='/var/mail/root' OPTIND='1' - PATH='/usr/sbin:/usr/bin:/sbin:/bin:/usr/games' + PATH='/usr/sbin:/usr/bin:/sbin:/bin:/usr/games:/i/capture/the/path' PBCURRENTCOMMANDLINEOPERATION='build' PBUILDER_OPERATION='build' PBUILDER_PKGDATADIR='/usr/share/pbuilder' PBUILDER_PKGLIBDIR='/usr/lib/pbuilder' PBUILDER_SYSCONFDIR='/etc' - PPID='636' + PPID='16887' PS1='# ' PS2='> ' PS4='+ ' PWD='/' SHELL='/bin/bash' SHLVL='2' - SUDO_COMMAND='/usr/bin/timeout -k 18.1h 18h /usr/bin/ionice -c 3 /usr/bin/nice /usr/sbin/pbuilder --build --configfile /srv/reproducible-results/rbuild-debian/r-b-build.0XzCFO1s/pbuilderrc_Gm8r --distribution bookworm --hookdir /etc/pbuilder/first-build-hooks --debbuildopts -b --basetgz /var/cache/pbuilder/bookworm-reproducible-base.tgz --buildresult /srv/reproducible-results/rbuild-debian/r-b-build.0XzCFO1s/b1 --logfile b1/build.log libbpp-popgen_2.4.1-8.dsc' + SUDO_COMMAND='/usr/bin/timeout -k 24.1h 24h /usr/bin/ionice -c 3 /usr/bin/nice -n 11 /usr/bin/unshare --uts -- /usr/sbin/pbuilder --build --configfile /srv/reproducible-results/rbuild-debian/r-b-build.0XzCFO1s/pbuilderrc_B0gu --distribution bookworm --hookdir /etc/pbuilder/rebuild-hooks --debbuildopts -b --basetgz /var/cache/pbuilder/bookworm-reproducible-base.tgz --buildresult /srv/reproducible-results/rbuild-debian/r-b-build.0XzCFO1s/b2 --logfile b2/build.log --extrapackages usrmerge libbpp-popgen_2.4.1-8.dsc' SUDO_GID='117' SUDO_UID='110' SUDO_USER='jenkins' TERM='unknown' - TZ='/usr/share/zoneinfo/Etc/GMT+12' + TZ='/usr/share/zoneinfo/Etc/GMT-14' USER='root' USERNAME='root' _='/usr/bin/systemd-run' http_proxy='http://192.168.101.16:3128' I: uname -a - Linux codethink10-arm64 4.15.0-208-generic #220-Ubuntu SMP Mon Mar 20 14:28:12 UTC 2023 aarch64 GNU/Linux + Linux i-capture-the-hostname 4.15.0-208-generic #220-Ubuntu SMP Mon Mar 20 14:28:12 UTC 2023 aarch64 GNU/Linux I: ls -l /bin - lrwxrwxrwx 1 root root 7 Apr 7 22:25 /bin -> usr/bin -I: user script /srv/workspace/pbuilder/636/tmp/hooks/D02_print_environment finished + lrwxrwxrwx 1 root root 7 May 12 06:48 /bin -> usr/bin +I: user script /srv/workspace/pbuilder/16887/tmp/hooks/D02_print_environment finished -> Attempting to satisfy build-dependencies -> Creating pbuilder-satisfydepends-dummy package Package: pbuilder-satisfydepends-dummy @@ -170,7 +179,7 @@ Get: 51 http://deb.debian.org/debian bookworm/main arm64 libbpp-core-dev arm64 2.4.1-9 [910 kB] Get: 52 http://deb.debian.org/debian bookworm/main arm64 libbpp-seq12 arm64 2.4.1-9 [430 kB] Get: 53 http://deb.debian.org/debian bookworm/main arm64 libbpp-seq-dev arm64 2.4.1-9 [708 kB] -Fetched 32.5 MB in 1s (32.7 MB/s) +Fetched 32.5 MB in 2s (18.0 MB/s) debconf: delaying package configuration, since apt-utils is not installed Selecting previously unselected package libproc2-0:arm64. (Reading database ... (Reading database ... 5% (Reading database ... 10% (Reading database ... 15% (Reading database ... 20% (Reading database ... 25% (Reading database ... 30% (Reading database ... 35% (Reading database ... 40% (Reading database ... 45% (Reading database ... 50% (Reading database ... 55% (Reading database ... 60% (Reading database ... 65% (Reading database ... 70% (Reading database ... 75% (Reading database ... 80% (Reading database ... 85% (Reading database ... 90% (Reading database ... 95% (Reading database ... 100% (Reading database ... 19616 files and directories currently installed.) @@ -396,8 +405,17 @@ Writing extended state information... Building tag database... -> Finished parsing the build-deps +Reading package lists... +Building dependency tree... +Reading state information... +usrmerge is already the newest version (35). +0 upgraded, 0 newly installed, 0 to remove and 0 not upgraded. I: Building the package -I: Running cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/ && env PATH="/usr/sbin:/usr/bin:/sbin:/bin:/usr/games" HOME="/nonexistent/first-build" dpkg-buildpackage -us -uc -b && env PATH="/usr/sbin:/usr/bin:/sbin:/bin:/usr/games" HOME="/nonexistent/first-build" dpkg-genchanges -S > ../libbpp-popgen_2.4.1-8_source.changes +I: user script /srv/workspace/pbuilder/16887/tmp/hooks/A99_set_merged_usr starting +Re-configuring usrmerge... +I: user script /srv/workspace/pbuilder/16887/tmp/hooks/A99_set_merged_usr finished +hostname: Temporary failure in name resolution +I: Running cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/ && env PATH="/usr/sbin:/usr/bin:/sbin:/bin:/usr/games:/i/capture/the/path" HOME="/nonexistent/second-build" dpkg-buildpackage -us -uc -b && env PATH="/usr/sbin:/usr/bin:/sbin:/bin:/usr/games:/i/capture/the/path" HOME="/nonexistent/second-build" dpkg-genchanges -S > ../libbpp-popgen_2.4.1-8_source.changes dpkg-buildpackage: info: source package libbpp-popgen dpkg-buildpackage: info: source version 2.4.1-8 dpkg-buildpackage: info: source distribution unstable @@ -455,150 +473,150 @@ make -f CMakeFiles/Makefile2 all make[2]: Entering directory '/build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu' make -f src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/build.make src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/depend +make -f src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/build.make src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/depend make[3]: Entering directory '/build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu' cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu && /usr/bin/cmake -E cmake_depends "Unix Makefiles" /build/libbpp-popgen-2.4.1 /build/libbpp-popgen-2.4.1/src /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/DependInfo.cmake --color= -make -f src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/build.make src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/depend make[3]: Entering directory '/build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu' cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu && /usr/bin/cmake -E cmake_depends "Unix Makefiles" /build/libbpp-popgen-2.4.1 /build/libbpp-popgen-2.4.1/src /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/DependInfo.cmake --color= make[3]: Leaving directory '/build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu' -make -f src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/build.make src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/build -make[3]: Entering directory '/build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu' make[3]: Leaving directory '/build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu' +make -f src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/build.make src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/build make -f src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/build.make src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/build make[3]: Entering directory '/build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu' -[ 1%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/BasicAlleleInfo.cpp.o -[ 3%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/BasicAlleleInfo.cpp.o -[ 4%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/BiAlleleMonolocusGenotype.cpp.o -[ 6%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/AnalyzedLoci.cpp.o +make[3]: Entering directory '/build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu' +[ 9%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/AnalyzedLoci.cpp.o +[ 9%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/AnalyzedLoci.cpp.o +[ 9%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/AnalyzedSequences.cpp.o +[ 9%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/BasicAlleleInfo.cpp.o +[ 9%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/BiAlleleMonolocusGenotype.cpp.o +[ 9%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/BasicAlleleInfo.cpp.o +[ 11%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/AnalyzedSequences.cpp.o +[ 12%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/BiAlleleMonolocusGenotype.cpp.o +cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/c++ -Dbpp_popgen_shared_EXPORTS -I/build/libbpp-popgen-2.4.1/src -g -O2 -ffile-prefix-map=/build/libbpp-popgen-2.4.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -fPIC -MD -MT src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/BiAlleleMonolocusGenotype.cpp.o -MF CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/BiAlleleMonolocusGenotype.cpp.o.d -o CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/BiAlleleMonolocusGenotype.cpp.o -c /build/libbpp-popgen-2.4.1/src/Bpp/PopGen/BiAlleleMonolocusGenotype.cpp cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/c++ -I/build/libbpp-popgen-2.4.1/src -g -O2 -ffile-prefix-map=/build/libbpp-popgen-2.4.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -MD -MT src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/BasicAlleleInfo.cpp.o -MF CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/BasicAlleleInfo.cpp.o.d -o CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/BasicAlleleInfo.cpp.o -c /build/libbpp-popgen-2.4.1/src/Bpp/PopGen/BasicAlleleInfo.cpp +cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/c++ -Dbpp_popgen_shared_EXPORTS -I/build/libbpp-popgen-2.4.1/src -g -O2 -ffile-prefix-map=/build/libbpp-popgen-2.4.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -fPIC -MD -MT src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/AnalyzedLoci.cpp.o -MF CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/AnalyzedLoci.cpp.o.d -o CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/AnalyzedLoci.cpp.o -c /build/libbpp-popgen-2.4.1/src/Bpp/PopGen/DataSet/AnalyzedLoci.cpp cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/c++ -I/build/libbpp-popgen-2.4.1/src -g -O2 -ffile-prefix-map=/build/libbpp-popgen-2.4.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -MD -MT src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/BiAlleleMonolocusGenotype.cpp.o -MF CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/BiAlleleMonolocusGenotype.cpp.o.d -o CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/BiAlleleMonolocusGenotype.cpp.o -c /build/libbpp-popgen-2.4.1/src/Bpp/PopGen/BiAlleleMonolocusGenotype.cpp -cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/c++ -Dbpp_popgen_shared_EXPORTS -I/build/libbpp-popgen-2.4.1/src -g -O2 -ffile-prefix-map=/build/libbpp-popgen-2.4.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -fPIC -MD -MT src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/BasicAlleleInfo.cpp.o -MF CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/BasicAlleleInfo.cpp.o.d -o CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/BasicAlleleInfo.cpp.o -c /build/libbpp-popgen-2.4.1/src/Bpp/PopGen/BasicAlleleInfo.cpp cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/c++ -I/build/libbpp-popgen-2.4.1/src -g -O2 -ffile-prefix-map=/build/libbpp-popgen-2.4.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -MD -MT src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/AnalyzedLoci.cpp.o -MF CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/AnalyzedLoci.cpp.o.d -o CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/AnalyzedLoci.cpp.o -c /build/libbpp-popgen-2.4.1/src/Bpp/PopGen/DataSet/AnalyzedLoci.cpp -[ 8%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/AnalyzedSequences.cpp.o -[ 9%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/DataSet.cpp.o +cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/c++ -Dbpp_popgen_shared_EXPORTS -I/build/libbpp-popgen-2.4.1/src -g -O2 -ffile-prefix-map=/build/libbpp-popgen-2.4.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -fPIC -MD -MT src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/BasicAlleleInfo.cpp.o -MF CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/BasicAlleleInfo.cpp.o.d -o CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/BasicAlleleInfo.cpp.o -c /build/libbpp-popgen-2.4.1/src/Bpp/PopGen/BasicAlleleInfo.cpp +cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/c++ -Dbpp_popgen_shared_EXPORTS -I/build/libbpp-popgen-2.4.1/src -g -O2 -ffile-prefix-map=/build/libbpp-popgen-2.4.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -fPIC -MD -MT src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/AnalyzedSequences.cpp.o -MF CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/AnalyzedSequences.cpp.o.d -o CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/AnalyzedSequences.cpp.o -c /build/libbpp-popgen-2.4.1/src/Bpp/PopGen/DataSet/AnalyzedSequences.cpp cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/c++ -I/build/libbpp-popgen-2.4.1/src -g -O2 -ffile-prefix-map=/build/libbpp-popgen-2.4.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -MD -MT src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/AnalyzedSequences.cpp.o -MF CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/AnalyzedSequences.cpp.o.d -o CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/AnalyzedSequences.cpp.o -c /build/libbpp-popgen-2.4.1/src/Bpp/PopGen/DataSet/AnalyzedSequences.cpp +[ 14%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/DataSet.cpp.o +cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/c++ -Dbpp_popgen_shared_EXPORTS -I/build/libbpp-popgen-2.4.1/src -g -O2 -ffile-prefix-map=/build/libbpp-popgen-2.4.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -fPIC -MD -MT src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/DataSet.cpp.o -MF CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/DataSet.cpp.o.d -o CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/DataSet.cpp.o -c /build/libbpp-popgen-2.4.1/src/Bpp/PopGen/DataSet/DataSet.cpp +[ 16%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/DataSet.cpp.o cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/c++ -I/build/libbpp-popgen-2.4.1/src -g -O2 -ffile-prefix-map=/build/libbpp-popgen-2.4.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -MD -MT src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/DataSet.cpp.o -MF CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/DataSet.cpp.o.d -o CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/DataSet.cpp.o -c /build/libbpp-popgen-2.4.1/src/Bpp/PopGen/DataSet/DataSet.cpp -[ 11%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/BiAlleleMonolocusGenotype.cpp.o -cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/c++ -Dbpp_popgen_shared_EXPORTS -I/build/libbpp-popgen-2.4.1/src -g -O2 -ffile-prefix-map=/build/libbpp-popgen-2.4.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -fPIC -MD -MT src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/BiAlleleMonolocusGenotype.cpp.o -MF CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/BiAlleleMonolocusGenotype.cpp.o.d -o CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/BiAlleleMonolocusGenotype.cpp.o -c /build/libbpp-popgen-2.4.1/src/Bpp/PopGen/BiAlleleMonolocusGenotype.cpp -[ 12%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/AnalyzedLoci.cpp.o -cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/c++ -Dbpp_popgen_shared_EXPORTS -I/build/libbpp-popgen-2.4.1/src -g -O2 -ffile-prefix-map=/build/libbpp-popgen-2.4.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -fPIC -MD -MT src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/AnalyzedLoci.cpp.o -MF CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/AnalyzedLoci.cpp.o.d -o CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/AnalyzedLoci.cpp.o -c /build/libbpp-popgen-2.4.1/src/Bpp/PopGen/DataSet/AnalyzedLoci.cpp -[ 14%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/AnalyzedSequences.cpp.o -cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/c++ -Dbpp_popgen_shared_EXPORTS -I/build/libbpp-popgen-2.4.1/src -g -O2 -ffile-prefix-map=/build/libbpp-popgen-2.4.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -fPIC -MD -MT src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/AnalyzedSequences.cpp.o -MF CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/AnalyzedSequences.cpp.o.d -o CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/AnalyzedSequences.cpp.o -c /build/libbpp-popgen-2.4.1/src/Bpp/PopGen/DataSet/AnalyzedSequences.cpp -[ 16%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/DataSetTools.cpp.o +[ 17%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/DataSetTools.cpp.o +cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/c++ -Dbpp_popgen_shared_EXPORTS -I/build/libbpp-popgen-2.4.1/src -g -O2 -ffile-prefix-map=/build/libbpp-popgen-2.4.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -fPIC -MD -MT src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/DataSetTools.cpp.o -MF CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/DataSetTools.cpp.o.d -o CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/DataSetTools.cpp.o -c /build/libbpp-popgen-2.4.1/src/Bpp/PopGen/DataSet/DataSetTools.cpp +[ 19%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/DataSetTools.cpp.o cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/c++ -I/build/libbpp-popgen-2.4.1/src -g -O2 -ffile-prefix-map=/build/libbpp-popgen-2.4.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -MD -MT src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/DataSetTools.cpp.o -MF CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/DataSetTools.cpp.o.d -o CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/DataSetTools.cpp.o -c /build/libbpp-popgen-2.4.1/src/Bpp/PopGen/DataSet/DataSetTools.cpp -[ 17%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Date.cpp.o +[ 20%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Date.cpp.o cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/c++ -I/build/libbpp-popgen-2.4.1/src -g -O2 -ffile-prefix-map=/build/libbpp-popgen-2.4.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -MD -MT src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Date.cpp.o -MF CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Date.cpp.o.d -o CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Date.cpp.o -c /build/libbpp-popgen-2.4.1/src/Bpp/PopGen/DataSet/Date.cpp -[ 19%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/DataSet.cpp.o -cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/c++ -Dbpp_popgen_shared_EXPORTS -I/build/libbpp-popgen-2.4.1/src -g -O2 -ffile-prefix-map=/build/libbpp-popgen-2.4.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -fPIC -MD -MT src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/DataSet.cpp.o -MF CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/DataSet.cpp.o.d -o CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/DataSet.cpp.o -c /build/libbpp-popgen-2.4.1/src/Bpp/PopGen/DataSet/DataSet.cpp -[ 20%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/DataSetTools.cpp.o -cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/c++ -Dbpp_popgen_shared_EXPORTS -I/build/libbpp-popgen-2.4.1/src -g -O2 -ffile-prefix-map=/build/libbpp-popgen-2.4.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -fPIC -MD -MT src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/DataSetTools.cpp.o -MF CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/DataSetTools.cpp.o.d -o CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/DataSetTools.cpp.o -c /build/libbpp-popgen-2.4.1/src/Bpp/PopGen/DataSet/DataSetTools.cpp -[ 22%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Group.cpp.o +[ 22%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Date.cpp.o +cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/c++ -Dbpp_popgen_shared_EXPORTS -I/build/libbpp-popgen-2.4.1/src -g -O2 -ffile-prefix-map=/build/libbpp-popgen-2.4.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -fPIC -MD -MT src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Date.cpp.o -MF CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Date.cpp.o.d -o CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Date.cpp.o -c /build/libbpp-popgen-2.4.1/src/Bpp/PopGen/DataSet/Date.cpp +[ 24%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Group.cpp.o +cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/c++ -Dbpp_popgen_shared_EXPORTS -I/build/libbpp-popgen-2.4.1/src -g -O2 -ffile-prefix-map=/build/libbpp-popgen-2.4.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -fPIC -MD -MT src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Group.cpp.o -MF CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Group.cpp.o.d -o CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Group.cpp.o -c /build/libbpp-popgen-2.4.1/src/Bpp/PopGen/DataSet/Group.cpp +[ 25%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Group.cpp.o cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/c++ -I/build/libbpp-popgen-2.4.1/src -g -O2 -ffile-prefix-map=/build/libbpp-popgen-2.4.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -MD -MT src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Group.cpp.o -MF CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Group.cpp.o.d -o CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Group.cpp.o -c /build/libbpp-popgen-2.4.1/src/Bpp/PopGen/DataSet/Group.cpp -[ 24%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Individual.cpp.o +[ 27%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Individual.cpp.o cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/c++ -I/build/libbpp-popgen-2.4.1/src -g -O2 -ffile-prefix-map=/build/libbpp-popgen-2.4.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -MD -MT src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Individual.cpp.o -MF CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Individual.cpp.o.d -o CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Individual.cpp.o -c /build/libbpp-popgen-2.4.1/src/Bpp/PopGen/DataSet/Individual.cpp -[ 25%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Date.cpp.o -cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/c++ -Dbpp_popgen_shared_EXPORTS -I/build/libbpp-popgen-2.4.1/src -g -O2 -ffile-prefix-map=/build/libbpp-popgen-2.4.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -fPIC -MD -MT src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Date.cpp.o -MF CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Date.cpp.o.d -o CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Date.cpp.o -c /build/libbpp-popgen-2.4.1/src/Bpp/PopGen/DataSet/Date.cpp -[ 27%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/AbstractIDataSet.cpp.o +[ 29%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Individual.cpp.o +cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/c++ -Dbpp_popgen_shared_EXPORTS -I/build/libbpp-popgen-2.4.1/src -g -O2 -ffile-prefix-map=/build/libbpp-popgen-2.4.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -fPIC -MD -MT src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Individual.cpp.o -MF CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Individual.cpp.o.d -o CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Individual.cpp.o -c /build/libbpp-popgen-2.4.1/src/Bpp/PopGen/DataSet/Individual.cpp +[ 30%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/AbstractIDataSet.cpp.o +cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/c++ -Dbpp_popgen_shared_EXPORTS -I/build/libbpp-popgen-2.4.1/src -g -O2 -ffile-prefix-map=/build/libbpp-popgen-2.4.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -fPIC -MD -MT src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/AbstractIDataSet.cpp.o -MF CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/AbstractIDataSet.cpp.o.d -o CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/AbstractIDataSet.cpp.o -c /build/libbpp-popgen-2.4.1/src/Bpp/PopGen/DataSet/Io/AbstractIDataSet.cpp +[ 32%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/AbstractIDataSet.cpp.o cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/c++ -I/build/libbpp-popgen-2.4.1/src -g -O2 -ffile-prefix-map=/build/libbpp-popgen-2.4.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -MD -MT src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/AbstractIDataSet.cpp.o -MF CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/AbstractIDataSet.cpp.o.d -o CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/AbstractIDataSet.cpp.o -c /build/libbpp-popgen-2.4.1/src/Bpp/PopGen/DataSet/Io/AbstractIDataSet.cpp -[ 29%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Group.cpp.o -cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/c++ -Dbpp_popgen_shared_EXPORTS -I/build/libbpp-popgen-2.4.1/src -g -O2 -ffile-prefix-map=/build/libbpp-popgen-2.4.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -fPIC -MD -MT src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Group.cpp.o -MF CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Group.cpp.o.d -o CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Group.cpp.o -c /build/libbpp-popgen-2.4.1/src/Bpp/PopGen/DataSet/Group.cpp -[ 30%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/AbstractODataSet.cpp.o +[ 33%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/AbstractODataSet.cpp.o cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/c++ -I/build/libbpp-popgen-2.4.1/src -g -O2 -ffile-prefix-map=/build/libbpp-popgen-2.4.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -MD -MT src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/AbstractODataSet.cpp.o -MF CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/AbstractODataSet.cpp.o.d -o CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/AbstractODataSet.cpp.o -c /build/libbpp-popgen-2.4.1/src/Bpp/PopGen/DataSet/Io/AbstractODataSet.cpp -[ 32%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Individual.cpp.o -cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/c++ -Dbpp_popgen_shared_EXPORTS -I/build/libbpp-popgen-2.4.1/src -g -O2 -ffile-prefix-map=/build/libbpp-popgen-2.4.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -fPIC -MD -MT src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Individual.cpp.o -MF CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Individual.cpp.o.d -o CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Individual.cpp.o -c /build/libbpp-popgen-2.4.1/src/Bpp/PopGen/DataSet/Individual.cpp -[ 33%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/Darwin/DarwinDon.cpp.o +[ 35%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/AbstractODataSet.cpp.o +cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/c++ -Dbpp_popgen_shared_EXPORTS -I/build/libbpp-popgen-2.4.1/src -g -O2 -ffile-prefix-map=/build/libbpp-popgen-2.4.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -fPIC -MD -MT src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/AbstractODataSet.cpp.o -MF CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/AbstractODataSet.cpp.o.d -o CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/AbstractODataSet.cpp.o -c /build/libbpp-popgen-2.4.1/src/Bpp/PopGen/DataSet/Io/AbstractODataSet.cpp +[ 37%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/Darwin/DarwinDon.cpp.o +cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/c++ -Dbpp_popgen_shared_EXPORTS -I/build/libbpp-popgen-2.4.1/src -g -O2 -ffile-prefix-map=/build/libbpp-popgen-2.4.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -fPIC -MD -MT src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/Darwin/DarwinDon.cpp.o -MF CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/Darwin/DarwinDon.cpp.o.d -o CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/Darwin/DarwinDon.cpp.o -c /build/libbpp-popgen-2.4.1/src/Bpp/PopGen/DataSet/Io/Darwin/DarwinDon.cpp +[ 38%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/Darwin/DarwinDon.cpp.o cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/c++ -I/build/libbpp-popgen-2.4.1/src -g -O2 -ffile-prefix-map=/build/libbpp-popgen-2.4.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -MD -MT src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/Darwin/DarwinDon.cpp.o -MF CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/Darwin/DarwinDon.cpp.o.d -o CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/Darwin/DarwinDon.cpp.o -c /build/libbpp-popgen-2.4.1/src/Bpp/PopGen/DataSet/Io/Darwin/DarwinDon.cpp -[ 35%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/Darwin/DarwinVarSingle.cpp.o +[ 40%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/Darwin/DarwinVarSingle.cpp.o +cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/c++ -Dbpp_popgen_shared_EXPORTS -I/build/libbpp-popgen-2.4.1/src -g -O2 -ffile-prefix-map=/build/libbpp-popgen-2.4.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -fPIC -MD -MT src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/Darwin/DarwinVarSingle.cpp.o -MF CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/Darwin/DarwinVarSingle.cpp.o.d -o CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/Darwin/DarwinVarSingle.cpp.o -c /build/libbpp-popgen-2.4.1/src/Bpp/PopGen/DataSet/Io/Darwin/DarwinVarSingle.cpp +[ 41%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/Darwin/DarwinVarSingle.cpp.o cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/c++ -I/build/libbpp-popgen-2.4.1/src -g -O2 -ffile-prefix-map=/build/libbpp-popgen-2.4.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -MD -MT src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/Darwin/DarwinVarSingle.cpp.o -MF CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/Darwin/DarwinVarSingle.cpp.o.d -o CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/Darwin/DarwinVarSingle.cpp.o -c /build/libbpp-popgen-2.4.1/src/Bpp/PopGen/DataSet/Io/Darwin/DarwinVarSingle.cpp -[ 37%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/GeneMapper/GeneMapperCsvExport.cpp.o +[ 43%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/GeneMapper/GeneMapperCsvExport.cpp.o +cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/c++ -Dbpp_popgen_shared_EXPORTS -I/build/libbpp-popgen-2.4.1/src -g -O2 -ffile-prefix-map=/build/libbpp-popgen-2.4.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -fPIC -MD -MT src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/GeneMapper/GeneMapperCsvExport.cpp.o -MF CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/GeneMapper/GeneMapperCsvExport.cpp.o.d -o CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/GeneMapper/GeneMapperCsvExport.cpp.o -c /build/libbpp-popgen-2.4.1/src/Bpp/PopGen/DataSet/Io/GeneMapper/GeneMapperCsvExport.cpp +[ 45%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/GeneMapper/GeneMapperCsvExport.cpp.o cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/c++ -I/build/libbpp-popgen-2.4.1/src -g -O2 -ffile-prefix-map=/build/libbpp-popgen-2.4.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -MD -MT src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/GeneMapper/GeneMapperCsvExport.cpp.o -MF CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/GeneMapper/GeneMapperCsvExport.cpp.o.d -o CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/GeneMapper/GeneMapperCsvExport.cpp.o -c /build/libbpp-popgen-2.4.1/src/Bpp/PopGen/DataSet/Io/GeneMapper/GeneMapperCsvExport.cpp -[ 38%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/Genepop/Genepop.cpp.o +[ 48%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/Genepop/Genepop.cpp.o +[ 48%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/Genepop/Genepop.cpp.o +cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/c++ -Dbpp_popgen_shared_EXPORTS -I/build/libbpp-popgen-2.4.1/src -g -O2 -ffile-prefix-map=/build/libbpp-popgen-2.4.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -fPIC -MD -MT src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/Genepop/Genepop.cpp.o -MF CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/Genepop/Genepop.cpp.o.d -o CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/Genepop/Genepop.cpp.o -c /build/libbpp-popgen-2.4.1/src/Bpp/PopGen/DataSet/Io/Genepop/Genepop.cpp cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/c++ -I/build/libbpp-popgen-2.4.1/src -g -O2 -ffile-prefix-map=/build/libbpp-popgen-2.4.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -MD -MT src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/Genepop/Genepop.cpp.o -MF CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/Genepop/Genepop.cpp.o.d -o CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/Genepop/Genepop.cpp.o -c /build/libbpp-popgen-2.4.1/src/Bpp/PopGen/DataSet/Io/Genepop/Genepop.cpp -[ 40%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/Genetix/Genetix.cpp.o +[ 50%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/Genetix/Genetix.cpp.o +cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/c++ -Dbpp_popgen_shared_EXPORTS -I/build/libbpp-popgen-2.4.1/src -g -O2 -ffile-prefix-map=/build/libbpp-popgen-2.4.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -fPIC -MD -MT src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/Genetix/Genetix.cpp.o -MF CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/Genetix/Genetix.cpp.o.d -o CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/Genetix/Genetix.cpp.o -c /build/libbpp-popgen-2.4.1/src/Bpp/PopGen/DataSet/Io/Genetix/Genetix.cpp +[ 51%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/Genetix/Genetix.cpp.o cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/c++ -I/build/libbpp-popgen-2.4.1/src -g -O2 -ffile-prefix-map=/build/libbpp-popgen-2.4.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -MD -MT src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/Genetix/Genetix.cpp.o -MF CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/Genetix/Genetix.cpp.o.d -o CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/Genetix/Genetix.cpp.o -c /build/libbpp-popgen-2.4.1/src/Bpp/PopGen/DataSet/Io/Genetix/Genetix.cpp -[ 41%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/AbstractIDataSet.cpp.o -cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/c++ -Dbpp_popgen_shared_EXPORTS -I/build/libbpp-popgen-2.4.1/src -g -O2 -ffile-prefix-map=/build/libbpp-popgen-2.4.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -fPIC -MD -MT src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/AbstractIDataSet.cpp.o -MF CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/AbstractIDataSet.cpp.o.d -o CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/AbstractIDataSet.cpp.o -c /build/libbpp-popgen-2.4.1/src/Bpp/PopGen/DataSet/Io/AbstractIDataSet.cpp -[ 43%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/AbstractODataSet.cpp.o -cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/c++ -Dbpp_popgen_shared_EXPORTS -I/build/libbpp-popgen-2.4.1/src -g -O2 -ffile-prefix-map=/build/libbpp-popgen-2.4.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -fPIC -MD -MT src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/AbstractODataSet.cpp.o -MF CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/AbstractODataSet.cpp.o.d -o CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/AbstractODataSet.cpp.o -c /build/libbpp-popgen-2.4.1/src/Bpp/PopGen/DataSet/Io/AbstractODataSet.cpp -[ 45%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/Darwin/DarwinDon.cpp.o -cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/c++ -Dbpp_popgen_shared_EXPORTS -I/build/libbpp-popgen-2.4.1/src -g -O2 -ffile-prefix-map=/build/libbpp-popgen-2.4.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -fPIC -MD -MT src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/Darwin/DarwinDon.cpp.o -MF CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/Darwin/DarwinDon.cpp.o.d -o CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/Darwin/DarwinDon.cpp.o -c /build/libbpp-popgen-2.4.1/src/Bpp/PopGen/DataSet/Io/Darwin/DarwinDon.cpp -[ 46%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/PopgenlibIO.cpp.o +[ 53%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/PopgenlibIO.cpp.o +cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/c++ -Dbpp_popgen_shared_EXPORTS -I/build/libbpp-popgen-2.4.1/src -g -O2 -ffile-prefix-map=/build/libbpp-popgen-2.4.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -fPIC -MD -MT src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/PopgenlibIO.cpp.o -MF CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/PopgenlibIO.cpp.o.d -o CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/PopgenlibIO.cpp.o -c /build/libbpp-popgen-2.4.1/src/Bpp/PopGen/DataSet/Io/PopgenlibIO.cpp +[ 54%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/PopgenlibIO.cpp.o cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/c++ -I/build/libbpp-popgen-2.4.1/src -g -O2 -ffile-prefix-map=/build/libbpp-popgen-2.4.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -MD -MT src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/PopgenlibIO.cpp.o -MF CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/PopgenlibIO.cpp.o.d -o CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/PopgenlibIO.cpp.o -c /build/libbpp-popgen-2.4.1/src/Bpp/PopGen/DataSet/Io/PopgenlibIO.cpp -[ 48%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/MultiSeqIndividual.cpp.o +[ 56%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/MultiSeqIndividual.cpp.o cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/c++ -I/build/libbpp-popgen-2.4.1/src -g -O2 -ffile-prefix-map=/build/libbpp-popgen-2.4.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -MD -MT src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/MultiSeqIndividual.cpp.o -MF CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/MultiSeqIndividual.cpp.o.d -o CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/MultiSeqIndividual.cpp.o -c /build/libbpp-popgen-2.4.1/src/Bpp/PopGen/DataSet/MultiSeqIndividual.cpp -[ 50%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/Darwin/DarwinVarSingle.cpp.o -cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/c++ -Dbpp_popgen_shared_EXPORTS -I/build/libbpp-popgen-2.4.1/src -g -O2 -ffile-prefix-map=/build/libbpp-popgen-2.4.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -fPIC -MD -MT src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/Darwin/DarwinVarSingle.cpp.o -MF CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/Darwin/DarwinVarSingle.cpp.o.d -o CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/Darwin/DarwinVarSingle.cpp.o -c /build/libbpp-popgen-2.4.1/src/Bpp/PopGen/DataSet/Io/Darwin/DarwinVarSingle.cpp -[ 51%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/GeneMapper/GeneMapperCsvExport.cpp.o -cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/c++ -Dbpp_popgen_shared_EXPORTS -I/build/libbpp-popgen-2.4.1/src -g -O2 -ffile-prefix-map=/build/libbpp-popgen-2.4.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -fPIC -MD -MT src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/GeneMapper/GeneMapperCsvExport.cpp.o -MF CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/GeneMapper/GeneMapperCsvExport.cpp.o.d -o CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/GeneMapper/GeneMapperCsvExport.cpp.o -c /build/libbpp-popgen-2.4.1/src/Bpp/PopGen/DataSet/Io/GeneMapper/GeneMapperCsvExport.cpp -[ 53%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/GeneralExceptions.cpp.o +[ 58%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/GeneralExceptions.cpp.o cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/c++ -I/build/libbpp-popgen-2.4.1/src -g -O2 -ffile-prefix-map=/build/libbpp-popgen-2.4.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -MD -MT src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/GeneralExceptions.cpp.o -MF CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/GeneralExceptions.cpp.o.d -o CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/GeneralExceptions.cpp.o -c /build/libbpp-popgen-2.4.1/src/Bpp/PopGen/GeneralExceptions.cpp -[ 54%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/Genepop/Genepop.cpp.o -cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/c++ -Dbpp_popgen_shared_EXPORTS -I/build/libbpp-popgen-2.4.1/src -g -O2 -ffile-prefix-map=/build/libbpp-popgen-2.4.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -fPIC -MD -MT src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/Genepop/Genepop.cpp.o -MF CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/Genepop/Genepop.cpp.o.d -o CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/Genepop/Genepop.cpp.o -c /build/libbpp-popgen-2.4.1/src/Bpp/PopGen/DataSet/Io/Genepop/Genepop.cpp -[ 56%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/LocusInfo.cpp.o -cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/c++ -I/build/libbpp-popgen-2.4.1/src -g -O2 -ffile-prefix-map=/build/libbpp-popgen-2.4.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -MD -MT src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/LocusInfo.cpp.o -MF CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/LocusInfo.cpp.o.d -o CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/LocusInfo.cpp.o -c /build/libbpp-popgen-2.4.1/src/Bpp/PopGen/LocusInfo.cpp -[ 58%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/MonoAlleleMonolocusGenotype.cpp.o -cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/c++ -I/build/libbpp-popgen-2.4.1/src -g -O2 -ffile-prefix-map=/build/libbpp-popgen-2.4.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -MD -MT src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/MonoAlleleMonolocusGenotype.cpp.o -MF CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/MonoAlleleMonolocusGenotype.cpp.o.d -o CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/MonoAlleleMonolocusGenotype.cpp.o -c /build/libbpp-popgen-2.4.1/src/Bpp/PopGen/MonoAlleleMonolocusGenotype.cpp -[ 59%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/MonolocusGenotypeTools.cpp.o -cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/c++ -I/build/libbpp-popgen-2.4.1/src -g -O2 -ffile-prefix-map=/build/libbpp-popgen-2.4.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -MD -MT src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/MonolocusGenotypeTools.cpp.o -MF CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/MonolocusGenotypeTools.cpp.o.d -o CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/MonolocusGenotypeTools.cpp.o -c /build/libbpp-popgen-2.4.1/src/Bpp/PopGen/MonolocusGenotypeTools.cpp -[ 61%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/MultiAlleleMonolocusGenotype.cpp.o -cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/c++ -I/build/libbpp-popgen-2.4.1/src -g -O2 -ffile-prefix-map=/build/libbpp-popgen-2.4.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -MD -MT src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/MultiAlleleMonolocusGenotype.cpp.o -MF CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/MultiAlleleMonolocusGenotype.cpp.o.d -o CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/MultiAlleleMonolocusGenotype.cpp.o -c /build/libbpp-popgen-2.4.1/src/Bpp/PopGen/MultiAlleleMonolocusGenotype.cpp -[ 62%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/MultilocusGenotype.cpp.o -cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/c++ -I/build/libbpp-popgen-2.4.1/src -g -O2 -ffile-prefix-map=/build/libbpp-popgen-2.4.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -MD -MT src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/MultilocusGenotype.cpp.o -MF CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/MultilocusGenotype.cpp.o.d -o CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/MultilocusGenotype.cpp.o -c /build/libbpp-popgen-2.4.1/src/Bpp/PopGen/MultilocusGenotype.cpp -[ 64%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/Genetix/Genetix.cpp.o -cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/c++ -Dbpp_popgen_shared_EXPORTS -I/build/libbpp-popgen-2.4.1/src -g -O2 -ffile-prefix-map=/build/libbpp-popgen-2.4.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -fPIC -MD -MT src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/Genetix/Genetix.cpp.o -MF CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/Genetix/Genetix.cpp.o.d -o CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/Genetix/Genetix.cpp.o -c /build/libbpp-popgen-2.4.1/src/Bpp/PopGen/DataSet/Io/Genetix/Genetix.cpp -[ 66%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/MultilocusGenotypeStatistics.cpp.o -cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/c++ -I/build/libbpp-popgen-2.4.1/src -g -O2 -ffile-prefix-map=/build/libbpp-popgen-2.4.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -MD -MT src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/MultilocusGenotypeStatistics.cpp.o -MF CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/MultilocusGenotypeStatistics.cpp.o.d -o CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/MultilocusGenotypeStatistics.cpp.o -c /build/libbpp-popgen-2.4.1/src/Bpp/PopGen/MultilocusGenotypeStatistics.cpp -[ 67%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/PolymorphismMultiGContainer.cpp.o -cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/c++ -I/build/libbpp-popgen-2.4.1/src -g -O2 -ffile-prefix-map=/build/libbpp-popgen-2.4.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -MD -MT src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/PolymorphismMultiGContainer.cpp.o -MF CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/PolymorphismMultiGContainer.cpp.o.d -o CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/PolymorphismMultiGContainer.cpp.o -c /build/libbpp-popgen-2.4.1/src/Bpp/PopGen/PolymorphismMultiGContainer.cpp -[ 69%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/PolymorphismMultiGContainerTools.cpp.o -cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/c++ -I/build/libbpp-popgen-2.4.1/src -g -O2 -ffile-prefix-map=/build/libbpp-popgen-2.4.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -MD -MT src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/PolymorphismMultiGContainerTools.cpp.o -MF CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/PolymorphismMultiGContainerTools.cpp.o.d -o CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/PolymorphismMultiGContainerTools.cpp.o -c /build/libbpp-popgen-2.4.1/src/Bpp/PopGen/PolymorphismMultiGContainerTools.cpp -[ 70%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/PolymorphismSequenceContainer.cpp.o -cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/c++ -I/build/libbpp-popgen-2.4.1/src -g -O2 -ffile-prefix-map=/build/libbpp-popgen-2.4.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -MD -MT src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/PolymorphismSequenceContainer.cpp.o -MF CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/PolymorphismSequenceContainer.cpp.o.d -o CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/PolymorphismSequenceContainer.cpp.o -c /build/libbpp-popgen-2.4.1/src/Bpp/PopGen/PolymorphismSequenceContainer.cpp -[ 72%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/PolymorphismSequenceContainerTools.cpp.o -cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/c++ -I/build/libbpp-popgen-2.4.1/src -g -O2 -ffile-prefix-map=/build/libbpp-popgen-2.4.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -MD -MT src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/PolymorphismSequenceContainerTools.cpp.o -MF CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/PolymorphismSequenceContainerTools.cpp.o.d -o CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/PolymorphismSequenceContainerTools.cpp.o -c /build/libbpp-popgen-2.4.1/src/Bpp/PopGen/PolymorphismSequenceContainerTools.cpp -[ 74%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/PopgenlibIO.cpp.o -cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/c++ -Dbpp_popgen_shared_EXPORTS -I/build/libbpp-popgen-2.4.1/src -g -O2 -ffile-prefix-map=/build/libbpp-popgen-2.4.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -fPIC -MD -MT src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/PopgenlibIO.cpp.o -MF CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/PopgenlibIO.cpp.o.d -o CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/PopgenlibIO.cpp.o -c /build/libbpp-popgen-2.4.1/src/Bpp/PopGen/DataSet/Io/PopgenlibIO.cpp -[ 75%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/MultiSeqIndividual.cpp.o +[ 59%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/MultiSeqIndividual.cpp.o cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/c++ -Dbpp_popgen_shared_EXPORTS -I/build/libbpp-popgen-2.4.1/src -g -O2 -ffile-prefix-map=/build/libbpp-popgen-2.4.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -fPIC -MD -MT src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/MultiSeqIndividual.cpp.o -MF CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/MultiSeqIndividual.cpp.o.d -o CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/MultiSeqIndividual.cpp.o -c /build/libbpp-popgen-2.4.1/src/Bpp/PopGen/DataSet/MultiSeqIndividual.cpp -[ 77%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/SequenceStatistics.cpp.o -cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/c++ -I/build/libbpp-popgen-2.4.1/src -g -O2 -ffile-prefix-map=/build/libbpp-popgen-2.4.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -MD -MT src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/SequenceStatistics.cpp.o -MF CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/SequenceStatistics.cpp.o.d -o CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/SequenceStatistics.cpp.o -c /build/libbpp-popgen-2.4.1/src/Bpp/PopGen/SequenceStatistics.cpp -[ 79%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/GeneralExceptions.cpp.o +[ 61%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/GeneralExceptions.cpp.o cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/c++ -Dbpp_popgen_shared_EXPORTS -I/build/libbpp-popgen-2.4.1/src -g -O2 -ffile-prefix-map=/build/libbpp-popgen-2.4.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -fPIC -MD -MT src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/GeneralExceptions.cpp.o -MF CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/GeneralExceptions.cpp.o.d -o CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/GeneralExceptions.cpp.o -c /build/libbpp-popgen-2.4.1/src/Bpp/PopGen/GeneralExceptions.cpp -[ 80%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/LocusInfo.cpp.o +[ 62%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/LocusInfo.cpp.o cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/c++ -Dbpp_popgen_shared_EXPORTS -I/build/libbpp-popgen-2.4.1/src -g -O2 -ffile-prefix-map=/build/libbpp-popgen-2.4.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -fPIC -MD -MT src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/LocusInfo.cpp.o -MF CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/LocusInfo.cpp.o.d -o CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/LocusInfo.cpp.o -c /build/libbpp-popgen-2.4.1/src/Bpp/PopGen/LocusInfo.cpp -[ 82%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/MonoAlleleMonolocusGenotype.cpp.o +[ 64%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/LocusInfo.cpp.o +cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/c++ -I/build/libbpp-popgen-2.4.1/src -g -O2 -ffile-prefix-map=/build/libbpp-popgen-2.4.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -MD -MT src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/LocusInfo.cpp.o -MF CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/LocusInfo.cpp.o.d -o CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/LocusInfo.cpp.o -c /build/libbpp-popgen-2.4.1/src/Bpp/PopGen/LocusInfo.cpp +[ 66%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/MonoAlleleMonolocusGenotype.cpp.o cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/c++ -Dbpp_popgen_shared_EXPORTS 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src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/MonoAlleleMonolocusGenotype.cpp.o -MF CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/MonoAlleleMonolocusGenotype.cpp.o.d -o CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/MonoAlleleMonolocusGenotype.cpp.o -c /build/libbpp-popgen-2.4.1/src/Bpp/PopGen/MonoAlleleMonolocusGenotype.cpp +[ 69%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/MonolocusGenotypeTools.cpp.o +cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/c++ -I/build/libbpp-popgen-2.4.1/src -g -O2 -ffile-prefix-map=/build/libbpp-popgen-2.4.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -MD -MT src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/MonolocusGenotypeTools.cpp.o -MF CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/MonolocusGenotypeTools.cpp.o.d -o CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/MonolocusGenotypeTools.cpp.o -c /build/libbpp-popgen-2.4.1/src/Bpp/PopGen/MonolocusGenotypeTools.cpp +[ 70%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/MonolocusGenotypeTools.cpp.o cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/c++ -Dbpp_popgen_shared_EXPORTS -I/build/libbpp-popgen-2.4.1/src -g -O2 -ffile-prefix-map=/build/libbpp-popgen-2.4.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -fPIC -MD -MT src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/MonolocusGenotypeTools.cpp.o -MF CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/MonolocusGenotypeTools.cpp.o.d -o CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/MonolocusGenotypeTools.cpp.o -c /build/libbpp-popgen-2.4.1/src/Bpp/PopGen/MonolocusGenotypeTools.cpp -[ 85%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/MultiAlleleMonolocusGenotype.cpp.o +[ 72%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/MultiAlleleMonolocusGenotype.cpp.o +cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/c++ -I/build/libbpp-popgen-2.4.1/src -g -O2 -ffile-prefix-map=/build/libbpp-popgen-2.4.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -MD -MT src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/MultiAlleleMonolocusGenotype.cpp.o -MF CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/MultiAlleleMonolocusGenotype.cpp.o.d -o CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/MultiAlleleMonolocusGenotype.cpp.o -c /build/libbpp-popgen-2.4.1/src/Bpp/PopGen/MultiAlleleMonolocusGenotype.cpp +[ 74%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/MultiAlleleMonolocusGenotype.cpp.o cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/c++ -Dbpp_popgen_shared_EXPORTS -I/build/libbpp-popgen-2.4.1/src -g -O2 -ffile-prefix-map=/build/libbpp-popgen-2.4.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -fPIC -MD -MT src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/MultiAlleleMonolocusGenotype.cpp.o -MF CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/MultiAlleleMonolocusGenotype.cpp.o.d -o CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/MultiAlleleMonolocusGenotype.cpp.o -c /build/libbpp-popgen-2.4.1/src/Bpp/PopGen/MultiAlleleMonolocusGenotype.cpp -[ 87%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/MultilocusGenotype.cpp.o +[ 75%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/MultilocusGenotype.cpp.o +cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/c++ -I/build/libbpp-popgen-2.4.1/src -g -O2 -ffile-prefix-map=/build/libbpp-popgen-2.4.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -MD -MT src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/MultilocusGenotype.cpp.o -MF CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/MultilocusGenotype.cpp.o.d -o CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/MultilocusGenotype.cpp.o -c /build/libbpp-popgen-2.4.1/src/Bpp/PopGen/MultilocusGenotype.cpp +[ 77%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/MultilocusGenotypeStatistics.cpp.o +cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/c++ -I/build/libbpp-popgen-2.4.1/src -g -O2 -ffile-prefix-map=/build/libbpp-popgen-2.4.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -MD -MT src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/MultilocusGenotypeStatistics.cpp.o -MF CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/MultilocusGenotypeStatistics.cpp.o.d -o CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/MultilocusGenotypeStatistics.cpp.o -c /build/libbpp-popgen-2.4.1/src/Bpp/PopGen/MultilocusGenotypeStatistics.cpp +[ 79%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/MultilocusGenotype.cpp.o cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/c++ -Dbpp_popgen_shared_EXPORTS -I/build/libbpp-popgen-2.4.1/src -g -O2 -ffile-prefix-map=/build/libbpp-popgen-2.4.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -fPIC -MD -MT src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/MultilocusGenotype.cpp.o -MF CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/MultilocusGenotype.cpp.o.d -o CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/MultilocusGenotype.cpp.o -c /build/libbpp-popgen-2.4.1/src/Bpp/PopGen/MultilocusGenotype.cpp -[ 88%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/MultilocusGenotypeStatistics.cpp.o +[ 80%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/MultilocusGenotypeStatistics.cpp.o cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/c++ -Dbpp_popgen_shared_EXPORTS -I/build/libbpp-popgen-2.4.1/src -g -O2 -ffile-prefix-map=/build/libbpp-popgen-2.4.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -fPIC -MD -MT src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/MultilocusGenotypeStatistics.cpp.o -MF CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/MultilocusGenotypeStatistics.cpp.o.d -o CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/MultilocusGenotypeStatistics.cpp.o -c /build/libbpp-popgen-2.4.1/src/Bpp/PopGen/MultilocusGenotypeStatistics.cpp -[ 90%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/PolymorphismMultiGContainer.cpp.o +[ 82%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/PolymorphismMultiGContainer.cpp.o +cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/c++ -I/build/libbpp-popgen-2.4.1/src -g -O2 -ffile-prefix-map=/build/libbpp-popgen-2.4.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -MD -MT src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/PolymorphismMultiGContainer.cpp.o -MF CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/PolymorphismMultiGContainer.cpp.o.d -o CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/PolymorphismMultiGContainer.cpp.o -c /build/libbpp-popgen-2.4.1/src/Bpp/PopGen/PolymorphismMultiGContainer.cpp +[ 83%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/PolymorphismMultiGContainer.cpp.o cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/c++ -Dbpp_popgen_shared_EXPORTS -I/build/libbpp-popgen-2.4.1/src -g -O2 -ffile-prefix-map=/build/libbpp-popgen-2.4.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -fPIC -MD -MT src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/PolymorphismMultiGContainer.cpp.o -MF CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/PolymorphismMultiGContainer.cpp.o.d -o CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/PolymorphismMultiGContainer.cpp.o -c /build/libbpp-popgen-2.4.1/src/Bpp/PopGen/PolymorphismMultiGContainer.cpp -[ 91%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/PolymorphismMultiGContainerTools.cpp.o +[ 85%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/PolymorphismMultiGContainerTools.cpp.o cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/c++ -Dbpp_popgen_shared_EXPORTS -I/build/libbpp-popgen-2.4.1/src -g -O2 -ffile-prefix-map=/build/libbpp-popgen-2.4.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -fPIC -MD -MT src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/PolymorphismMultiGContainerTools.cpp.o -MF CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/PolymorphismMultiGContainerTools.cpp.o.d -o CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/PolymorphismMultiGContainerTools.cpp.o -c /build/libbpp-popgen-2.4.1/src/Bpp/PopGen/PolymorphismMultiGContainerTools.cpp -[ 93%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/PolymorphismSequenceContainer.cpp.o +[ 87%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/PolymorphismMultiGContainerTools.cpp.o +cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/c++ -I/build/libbpp-popgen-2.4.1/src -g -O2 -ffile-prefix-map=/build/libbpp-popgen-2.4.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -MD -MT src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/PolymorphismMultiGContainerTools.cpp.o -MF CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/PolymorphismMultiGContainerTools.cpp.o.d -o CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/PolymorphismMultiGContainerTools.cpp.o -c /build/libbpp-popgen-2.4.1/src/Bpp/PopGen/PolymorphismMultiGContainerTools.cpp +[ 88%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/PolymorphismSequenceContainer.cpp.o +cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/c++ -I/build/libbpp-popgen-2.4.1/src -g -O2 -ffile-prefix-map=/build/libbpp-popgen-2.4.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -MD -MT src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/PolymorphismSequenceContainer.cpp.o -MF CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/PolymorphismSequenceContainer.cpp.o.d -o CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/PolymorphismSequenceContainer.cpp.o -c /build/libbpp-popgen-2.4.1/src/Bpp/PopGen/PolymorphismSequenceContainer.cpp +[ 90%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/PolymorphismSequenceContainer.cpp.o cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/c++ -Dbpp_popgen_shared_EXPORTS -I/build/libbpp-popgen-2.4.1/src -g -O2 -ffile-prefix-map=/build/libbpp-popgen-2.4.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -fPIC -MD -MT src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/PolymorphismSequenceContainer.cpp.o -MF CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/PolymorphismSequenceContainer.cpp.o.d -o CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/PolymorphismSequenceContainer.cpp.o -c /build/libbpp-popgen-2.4.1/src/Bpp/PopGen/PolymorphismSequenceContainer.cpp -[ 95%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/PolymorphismSequenceContainerTools.cpp.o +[ 91%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/PolymorphismSequenceContainerTools.cpp.o cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/c++ -Dbpp_popgen_shared_EXPORTS -I/build/libbpp-popgen-2.4.1/src -g -O2 -ffile-prefix-map=/build/libbpp-popgen-2.4.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -fPIC -MD -MT src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/PolymorphismSequenceContainerTools.cpp.o -MF CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/PolymorphismSequenceContainerTools.cpp.o.d -o CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/PolymorphismSequenceContainerTools.cpp.o -c /build/libbpp-popgen-2.4.1/src/Bpp/PopGen/PolymorphismSequenceContainerTools.cpp -[ 96%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/SequenceStatistics.cpp.o +[ 93%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/PolymorphismSequenceContainerTools.cpp.o +cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/c++ -I/build/libbpp-popgen-2.4.1/src -g -O2 -ffile-prefix-map=/build/libbpp-popgen-2.4.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -MD -MT src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/PolymorphismSequenceContainerTools.cpp.o -MF CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/PolymorphismSequenceContainerTools.cpp.o.d -o CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/PolymorphismSequenceContainerTools.cpp.o -c /build/libbpp-popgen-2.4.1/src/Bpp/PopGen/PolymorphismSequenceContainerTools.cpp +[ 95%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/SequenceStatistics.cpp.o cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/c++ -Dbpp_popgen_shared_EXPORTS -I/build/libbpp-popgen-2.4.1/src -g -O2 -ffile-prefix-map=/build/libbpp-popgen-2.4.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -fPIC -MD -MT src/CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/SequenceStatistics.cpp.o -MF CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/SequenceStatistics.cpp.o.d -o CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/SequenceStatistics.cpp.o -c /build/libbpp-popgen-2.4.1/src/Bpp/PopGen/SequenceStatistics.cpp -[ 98%] Linking CXX static library libbpp-popgen.a +[ 96%] Building CXX object src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/SequenceStatistics.cpp.o +cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/c++ -I/build/libbpp-popgen-2.4.1/src -g -O2 -ffile-prefix-map=/build/libbpp-popgen-2.4.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -MD -MT src/CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/SequenceStatistics.cpp.o -MF CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/SequenceStatistics.cpp.o.d -o CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/SequenceStatistics.cpp.o -c /build/libbpp-popgen-2.4.1/src/Bpp/PopGen/SequenceStatistics.cpp +[ 98%] Linking CXX shared library libbpp-popgen.so +cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/cmake -E cmake_link_script CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/link.txt --verbose=1 +/usr/bin/c++ -fPIC -g -O2 -ffile-prefix-map=/build/libbpp-popgen-2.4.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -Wl,-z,relro -Wl,-z,now -shared -Wl,-soname,libbpp-popgen.so.8 -o libbpp-popgen.so.8.0.0 "CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/BasicAlleleInfo.cpp.o" "CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/BiAlleleMonolocusGenotype.cpp.o" "CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/AnalyzedLoci.cpp.o" "CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/AnalyzedSequences.cpp.o" "CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/DataSet.cpp.o" "CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/DataSetTools.cpp.o" "CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Date.cpp.o" "CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Group.cpp.o" "CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Individual.cpp.o" "CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/AbstractIDataSet.cpp.o" "CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/AbstractODataSet.cpp.o" "CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/Darwin/DarwinDon.cpp.o" "CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/Darwin/DarwinVarSingle.cpp.o" "CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/GeneMapper/GeneMapperCsvExport.cpp.o" "CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/Genepop/Genepop.cpp.o" "CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/Genetix/Genetix.cpp.o" "CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/PopgenlibIO.cpp.o" "CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/MultiSeqIndividual.cpp.o" "CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/GeneralExceptions.cpp.o" "CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/LocusInfo.cpp.o" "CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/MonoAlleleMonolocusGenotype.cpp.o" "CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/MonolocusGenotypeTools.cpp.o" "CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/MultiAlleleMonolocusGenotype.cpp.o" "CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/MultilocusGenotype.cpp.o" "CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/MultilocusGenotypeStatistics.cpp.o" "CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/PolymorphismMultiGContainer.cpp.o" "CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/PolymorphismMultiGContainerTools.cpp.o" "CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/PolymorphismSequenceContainer.cpp.o" "CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/PolymorphismSequenceContainerTools.cpp.o" "CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/SequenceStatistics.cpp.o" /usr/lib/aarch64-linux-gnu/libbpp-seq.so.12.0.0 /usr/lib/aarch64-linux-gnu/libbpp-core.so.4.1.0 +[100%] Linking CXX static library libbpp-popgen.a cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/cmake -P CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/cmake_clean_target.cmake cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/cmake -E cmake_link_script CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/link.txt --verbose=1 /usr/bin/ar qc libbpp-popgen.a "CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/BasicAlleleInfo.cpp.o" "CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/BiAlleleMonolocusGenotype.cpp.o" "CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/AnalyzedLoci.cpp.o" "CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/AnalyzedSequences.cpp.o" "CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/DataSet.cpp.o" "CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/DataSetTools.cpp.o" "CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Date.cpp.o" "CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Group.cpp.o" "CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Individual.cpp.o" "CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/AbstractIDataSet.cpp.o" "CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/AbstractODataSet.cpp.o" "CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/Darwin/DarwinDon.cpp.o" "CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/Darwin/DarwinVarSingle.cpp.o" "CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/GeneMapper/GeneMapperCsvExport.cpp.o" "CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/Genepop/Genepop.cpp.o" "CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/Genetix/Genetix.cpp.o" "CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/PopgenlibIO.cpp.o" "CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/DataSet/MultiSeqIndividual.cpp.o" "CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/GeneralExceptions.cpp.o" "CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/LocusInfo.cpp.o" "CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/MonoAlleleMonolocusGenotype.cpp.o" "CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/MonolocusGenotypeTools.cpp.o" "CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/MultiAlleleMonolocusGenotype.cpp.o" "CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/MultilocusGenotype.cpp.o" "CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/MultilocusGenotypeStatistics.cpp.o" "CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/PolymorphismMultiGContainer.cpp.o" "CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/PolymorphismMultiGContainerTools.cpp.o" "CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/PolymorphismSequenceContainer.cpp.o" "CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/PolymorphismSequenceContainerTools.cpp.o" "CMakeFiles/bpp-popgen-static.dir/Bpp/PopGen/SequenceStatistics.cpp.o" /usr/bin/ranlib libbpp-popgen.a -make[3]: Leaving directory '/build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu' -[ 98%] Built target bpp-popgen-static -[100%] Linking CXX shared library libbpp-popgen.so -cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/cmake -E cmake_link_script CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/link.txt --verbose=1 -/usr/bin/c++ -fPIC -g -O2 -ffile-prefix-map=/build/libbpp-popgen-2.4.1=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -Wl,-z,relro -Wl,-z,now -shared -Wl,-soname,libbpp-popgen.so.8 -o libbpp-popgen.so.8.0.0 "CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/BasicAlleleInfo.cpp.o" "CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/BiAlleleMonolocusGenotype.cpp.o" "CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/AnalyzedLoci.cpp.o" "CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/AnalyzedSequences.cpp.o" "CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/DataSet.cpp.o" "CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/DataSetTools.cpp.o" "CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Date.cpp.o" "CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Group.cpp.o" "CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Individual.cpp.o" "CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/AbstractIDataSet.cpp.o" "CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/AbstractODataSet.cpp.o" "CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/Darwin/DarwinDon.cpp.o" "CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/Darwin/DarwinVarSingle.cpp.o" "CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/GeneMapper/GeneMapperCsvExport.cpp.o" "CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/Genepop/Genepop.cpp.o" "CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/Genetix/Genetix.cpp.o" "CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/Io/PopgenlibIO.cpp.o" "CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/DataSet/MultiSeqIndividual.cpp.o" "CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/GeneralExceptions.cpp.o" "CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/LocusInfo.cpp.o" "CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/MonoAlleleMonolocusGenotype.cpp.o" "CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/MonolocusGenotypeTools.cpp.o" "CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/MultiAlleleMonolocusGenotype.cpp.o" "CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/MultilocusGenotype.cpp.o" "CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/MultilocusGenotypeStatistics.cpp.o" "CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/PolymorphismMultiGContainer.cpp.o" "CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/PolymorphismMultiGContainerTools.cpp.o" "CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/PolymorphismSequenceContainer.cpp.o" "CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/PolymorphismSequenceContainerTools.cpp.o" "CMakeFiles/bpp-popgen-shared.dir/Bpp/PopGen/SequenceStatistics.cpp.o" /usr/lib/aarch64-linux-gnu/libbpp-seq.so.12.0.0 /usr/lib/aarch64-linux-gnu/libbpp-core.so.4.1.0 cd /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/src && /usr/bin/cmake -E cmake_symlink_library libbpp-popgen.so.8.0.0 libbpp-popgen.so.8 libbpp-popgen.so make[3]: Leaving directory '/build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu' [100%] Built target bpp-popgen-shared +make[3]: Leaving directory '/build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu' +[100%] Built target bpp-popgen-static make[2]: Leaving directory '/build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu' /usr/bin/cmake -E cmake_progress_start /build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu/CMakeFiles 0 make[1]: Leaving directory '/build/libbpp-popgen-2.4.1/obj-aarch64-linux-gnu' @@ -710,7 +728,7 @@ dpkg-gensymbols: warning: some libraries disappeared in the symbols file: libbpp-popgen.so.8 dpkg-gensymbols: warning: the generated symbols file is empty --- debian/symbols (libbpp-popgen-dev_2.4.1-8_arm64) -+++ dpkg-gensymbolsblMHoV 2023-04-09 03:39:21.129777116 -1200 ++++ dpkg-gensymbols5kWz7Z 2024-05-12 12:04:25.409761560 +1400 @@ -1,1361 +0,0 @@ -libbpp-popgen.so.8 libbpp-popgen8 #MINVER# - _ZN3bpp10Individual11addSequenceEmRKNS_8SequenceE@Base 2.4.1 @@ -2088,12 +2106,14 @@ dpkg-buildpackage: info: binary-only upload (no source included) dpkg-genchanges: info: not including original source code in upload I: copying local configuration +I: user script /srv/workspace/pbuilder/16887/tmp/hooks/B01_cleanup starting +I: user script /srv/workspace/pbuilder/16887/tmp/hooks/B01_cleanup finished I: unmounting dev/ptmx filesystem I: unmounting dev/pts filesystem I: unmounting dev/shm filesystem I: unmounting proc filesystem I: unmounting sys filesystem I: cleaning the build env -I: removing directory /srv/workspace/pbuilder/636 and its subdirectories -I: Current time: Sun Apr 9 03:39:30 -12 2023 -I: pbuilder-time-stamp: 1681054770 +I: removing directory /srv/workspace/pbuilder/16887 and its subdirectories +I: Current time: Sun May 12 12:04:36 +14 2024 +I: 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