--- /srv/reproducible-results/rbuild-debian/r-b-build.idlALzRH/b1/python-gsd_3.3.0-1_armhf.changes +++ /srv/reproducible-results/rbuild-debian/r-b-build.idlALzRH/b2/python-gsd_3.3.0-1_armhf.changes ├── Files │ @@ -1,4 +1,4 @@ │ │ - 17505a5c601d94685c377adda079e13e 130396 doc optional python-gsd-doc_3.3.0-1_all.deb │ + b9fdbb0acd535217398288c409a60e03 130384 doc optional python-gsd-doc_3.3.0-1_all.deb │ 282233913b584018758441d795f7367f 341964 debug optional python3-gsd-dbgsym_3.3.0-1_armhf.deb │ 6df2a34c5de8127fa9915060ff3af3ac 192848 python optional python3-gsd_3.3.0-1_armhf.deb ├── python-gsd-doc_3.3.0-1_all.deb │ ├── file list │ │ @@ -1,3 +1,3 @@ │ │ -rw-r--r-- 0 0 0 4 2024-07-05 16:19:20.000000 debian-binary │ │ -rw-r--r-- 0 0 0 2692 2024-07-05 16:19:20.000000 control.tar.xz │ │ --rw-r--r-- 0 0 0 127512 2024-07-05 16:19:20.000000 data.tar.xz │ │ +-rw-r--r-- 0 0 0 127500 2024-07-05 16:19:20.000000 data.tar.xz │ ├── control.tar.xz │ │ ├── control.tar │ │ │ ├── ./md5sums │ │ │ │ ├── ./md5sums │ │ │ │ │┄ Files differ │ ├── data.tar.xz │ │ ├── data.tar │ │ │ ├── file list │ │ │ │ @@ -71,15 +71,15 @@ │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 23394 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/python-api.html │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 87526 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/python-module-gsd.fl.html │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 95472 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/python-module-gsd.hoomd.html │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 49307 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/python-module-gsd.pygsd.html │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 18756 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/python-module-gsd.version.html │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 107555 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/schema-hoomd.html │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 16660 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/search.html │ │ │ │ --rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 82710 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/searchindex.js │ │ │ │ +-rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 82711 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/searchindex.js │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 32666 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/shapes.html │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 20804 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/specification.html │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 24988 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/style.html │ │ │ │ drwxr-xr-x 0 root (0) root (0) 0 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc-base/ │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 331 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc-base/python-gsd-doc.python-gsd │ │ │ │ lrwxrwxrwx 0 root (0) root (0) 0 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/_static/doctools.js -> ../../../../javascript/sphinxdoc/1.0/doctools.js │ │ │ │ lrwxrwxrwx 0 root (0) root (0) 0 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/_static/language_data.js -> ../../../../javascript/sphinxdoc/1.0/language_data.js │ │ │ ├── ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/hoomd-examples.html │ │ │ │ @@ -355,23 +355,23 @@ │ │ │ │ Out[16]: 5 │ │ │ │ │ │ │ │ In [17]: frame.particles.N │ │ │ │ Out[17]: 9 │ │ │ │ │ │ │ │ In [18]: frame.particles.position │ │ │ │ Out[18]: │ │ │ │ -array([[0.5820385 , 0.78381735, 0.3796044 ], │ │ │ │ - [0.4972064 , 0.6588702 , 0.5139418 ], │ │ │ │ - [0.50547403, 0.505034 , 0.9411819 ], │ │ │ │ - [0.5944673 , 0.903661 , 0.5821638 ], │ │ │ │ - [0.80676115, 0.71070987, 0.17071101], │ │ │ │ - [0.97170377, 0.47321656, 0.453243 ], │ │ │ │ - [0.98979634, 0.7429908 , 0.3354479 ], │ │ │ │ - [0.9989154 , 0.8565489 , 0.85034865], │ │ │ │ - [0.99203366, 0.10741754, 0.1708654 ]], dtype=float32) │ │ │ │ +array([[0.43797806, 0.20673501, 0.07877223], │ │ │ │ + [0.42677975, 0.6079317 , 0.6460697 ], │ │ │ │ + [0.03314833, 0.37091202, 0.48208618], │ │ │ │ + [0.90122086, 0.1614931 , 0.05273489], │ │ │ │ + [0.44480878, 0.65923005, 0.9001247 ], │ │ │ │ + [0.08550329, 0.782354 , 0.7550921 ], │ │ │ │ + [0.0102686 , 0.9362271 , 0.8669989 ], │ │ │ │ + [0.5459706 , 0.8208881 , 0.98105085], │ │ │ │ + [0.5673919 , 0.35156927, 0.4191816 ]], dtype=float32) │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ │

gsd.hoomd.HOOMDTrajectory supports random indexing of frames in the file. │ │ │ │ Indexing into a trajectory returns a gsd.hoomd.Frame.

│ │ │ │ │ │ │ │
│ │ │ │

Slicing and selection

│ │ │ │ @@ -398,21 +398,21 @@ │ │ │ │

Pure python reader

│ │ │ │
In [23]: f = gsd.pygsd.GSDFile(open('example.gsd', 'rb'))
│ │ │ │  
│ │ │ │  In [24]: trajectory = gsd.hoomd.HOOMDTrajectory(f);
│ │ │ │  
│ │ │ │  In [25]: trajectory[3].particles.position
│ │ │ │  Out[25]: 
│ │ │ │ -array([[0.56937736, 0.36090612, 0.08444197],
│ │ │ │ -       [0.81767064, 0.5891389 , 0.52570784],
│ │ │ │ -       [0.6147773 , 0.22818811, 0.04388472],
│ │ │ │ -       [0.15879309, 0.55443   , 0.79213   ],
│ │ │ │ -       [0.02496225, 0.78359914, 0.05256526],
│ │ │ │ -       [0.22676492, 0.74552315, 0.44213656],
│ │ │ │ -       [0.6490232 , 0.8053516 , 0.10685506]], dtype=float32)
│ │ │ │ +array([[0.318956  , 0.9852199 , 0.35520285],
│ │ │ │ +       [0.7627266 , 0.8040645 , 0.35519972],
│ │ │ │ +       [0.43195474, 0.07768448, 0.6105821 ],
│ │ │ │ +       [0.7662494 , 0.33344215, 0.4538345 ],
│ │ │ │ +       [0.12536071, 0.6268418 , 0.20186798],
│ │ │ │ +       [0.4967294 , 0.8545378 , 0.7122107 ],
│ │ │ │ +       [0.68172616, 0.5352891 , 0.6186649 ]], dtype=float32)
│ │ │ │  
│ │ │ │
│ │ │ │

You can use GSD without needing to compile C code to read GSD files │ │ │ │ using gsd.pygsd.GSDFile in combination with gsd.hoomd.HOOMDTrajectory. It │ │ │ │ only supports the rb mode and does not read files as fast as the C │ │ │ │ implementation. It takes in a python file-like object, so it can be used with │ │ │ │ in-memory IO classes, and grid file classes that access data over the internet.

│ │ │ │ ├── html2text {} │ │ │ │ │ @@ -95,23 +95,23 @@ │ │ │ │ │ Out[16]: 5 │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ In [17]: frame.particles.N │ │ │ │ │ Out[17]: 9 │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ In [18]: frame.particles.position │ │ │ │ │ Out[18]: │ │ │ │ │ -array([[0.5820385 , 0.78381735, 0.3796044 ], │ │ │ │ │ - [0.4972064 , 0.6588702 , 0.5139418 ], │ │ │ │ │ - [0.50547403, 0.505034 , 0.9411819 ], │ │ │ │ │ - [0.5944673 , 0.903661 , 0.5821638 ], │ │ │ │ │ - [0.80676115, 0.71070987, 0.17071101], │ │ │ │ │ - [0.97170377, 0.47321656, 0.453243 ], │ │ │ │ │ - [0.98979634, 0.7429908 , 0.3354479 ], │ │ │ │ │ - [0.9989154 , 0.8565489 , 0.85034865], │ │ │ │ │ - [0.99203366, 0.10741754, 0.1708654 ]], dtype=float32) │ │ │ │ │ +array([[0.43797806, 0.20673501, 0.07877223], │ │ │ │ │ + [0.42677975, 0.6079317 , 0.6460697 ], │ │ │ │ │ + [0.03314833, 0.37091202, 0.48208618], │ │ │ │ │ + [0.90122086, 0.1614931 , 0.05273489], │ │ │ │ │ + [0.44480878, 0.65923005, 0.9001247 ], │ │ │ │ │ + [0.08550329, 0.782354 , 0.7550921 ], │ │ │ │ │ + [0.0102686 , 0.9362271 , 0.8669989 ], │ │ │ │ │ + [0.5459706 , 0.8208881 , 0.98105085], │ │ │ │ │ + [0.5673919 , 0.35156927, 0.4191816 ]], dtype=float32) │ │ │ │ │ _g_s_d_._h_o_o_m_d_._H_O_O_M_D_T_r_a_j_e_c_t_o_r_y supports random indexing of frames in the file. │ │ │ │ │ Indexing into a trajectory returns a _g_s_d_._h_o_o_m_d_._F_r_a_m_e. │ │ │ │ │ ********** SSlliicciinngg aanndd sseelleeccttiioonn_?¶ ********** │ │ │ │ │ Use the slicing operator to select individual frames or a subset of a │ │ │ │ │ trajectory. │ │ │ │ │ In [19]: f = gsd.hoomd.open(name='example.gsd', mode='r') │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ @@ -130,21 +130,21 @@ │ │ │ │ │ ********** PPuurree ppyytthhoonn rreeaaddeerr_?¶ ********** │ │ │ │ │ In [23]: f = gsd.pygsd.GSDFile(open('example.gsd', 'rb')) │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ In [24]: trajectory = gsd.hoomd.HOOMDTrajectory(f); │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ In [25]: trajectory[3].particles.position │ │ │ │ │ Out[25]: │ │ │ │ │ -array([[0.56937736, 0.36090612, 0.08444197], │ │ │ │ │ - [0.81767064, 0.5891389 , 0.52570784], │ │ │ │ │ - [0.6147773 , 0.22818811, 0.04388472], │ │ │ │ │ - [0.15879309, 0.55443 , 0.79213 ], │ │ │ │ │ - [0.02496225, 0.78359914, 0.05256526], │ │ │ │ │ - [0.22676492, 0.74552315, 0.44213656], │ │ │ │ │ - [0.6490232 , 0.8053516 , 0.10685506]], dtype=float32) │ │ │ │ │ +array([[0.318956 , 0.9852199 , 0.35520285], │ │ │ │ │ + [0.7627266 , 0.8040645 , 0.35519972], │ │ │ │ │ + [0.43195474, 0.07768448, 0.6105821 ], │ │ │ │ │ + [0.7662494 , 0.33344215, 0.4538345 ], │ │ │ │ │ + [0.12536071, 0.6268418 , 0.20186798], │ │ │ │ │ + [0.4967294 , 0.8545378 , 0.7122107 ], │ │ │ │ │ + [0.68172616, 0.5352891 , 0.6186649 ]], dtype=float32) │ │ │ │ │ You can use GGSSDD without needing to compile C code to read GGSSDD files using │ │ │ │ │ _g_s_d_._p_y_g_s_d_._G_S_D_F_i_l_e in combination with _g_s_d_._h_o_o_m_d_._H_O_O_M_D_T_r_a_j_e_c_t_o_r_y. It only │ │ │ │ │ supports the rb mode and does not read files as fast as the C implementation. │ │ │ │ │ It takes in a python file-like object, so it can be used with in-memory IO │ │ │ │ │ classes, and grid file classes that access data over the internet. │ │ │ │ │ Warning │ │ │ │ │ _g_s_d_._p_y_g_s_d is ssllooww. Use _g_s_d_._h_o_o_m_d_._o_p_e_n whenever possible. │ │ │ ├── ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/searchindex.js │ │ │ │ ├── js-beautify {} │ │ │ │ │ @@ -1870,59 +1870,58 @@ │ │ │ │ │ "12": "py:property", │ │ │ │ │ "13": "std:chunk", │ │ │ │ │ "14": "std:cmdoption" │ │ │ │ │ }, │ │ │ │ │ "terms": { │ │ │ │ │ "": [1, 2, 3, 7, 8, 11, 13, 14, 18, 21], │ │ │ │ │ "0": [0, 6, 7, 8, 11, 14, 15, 16, 18, 19], │ │ │ │ │ - "02496225": 8, │ │ │ │ │ - "04388472": 8, │ │ │ │ │ - "05256526": 8, │ │ │ │ │ - "08444197": 8, │ │ │ │ │ + "0102686": 8, │ │ │ │ │ + "03314833": 8, │ │ │ │ │ + "05273489": 8, │ │ │ │ │ + "07768448": 8, │ │ │ │ │ + "07877223": 8, │ │ │ │ │ + "08550329": 8, │ │ │ │ │ "0x65df65df65df65df": 6, │ │ │ │ │ "0xaaaabbbb": 6, │ │ │ │ │ "1": [0, 6, 7, 8, 11, 12, 14, 15, 16, 18, 19], │ │ │ │ │ "10": [7, 8, 11, 14, 15], │ │ │ │ │ "100": [8, 15, 21], │ │ │ │ │ "103": 7, │ │ │ │ │ "104": 7, │ │ │ │ │ "105": 7, │ │ │ │ │ - "10685506": 8, │ │ │ │ │ - "10741754": 8, │ │ │ │ │ "11": [7, 8, 14, 21], │ │ │ │ │ "110": 7, │ │ │ │ │ "114": 7, │ │ │ │ │ "115": 7, │ │ │ │ │ "116": 7, │ │ │ │ │ "12": [7, 8, 14], │ │ │ │ │ + "12536071": 8, │ │ │ │ │ "127": 1, │ │ │ │ │ "12_gsd": [7, 8, 14], │ │ │ │ │ "13": [7, 8, 14], │ │ │ │ │ "14": [7, 8, 11, 14], │ │ │ │ │ "15": [7, 8, 14], │ │ │ │ │ - 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"3354479": 8, │ │ │ │ │ + "33344215": 8, │ │ │ │ │ "34": 7, │ │ │ │ │ "35": 7, │ │ │ │ │ + "35156927": 8, │ │ │ │ │ + "35519972": 8, │ │ │ │ │ + "35520285": 8, │ │ │ │ │ "36": 7, │ │ │ │ │ - "36090612": 8, │ │ │ │ │ "365": 1, │ │ │ │ │ "367": 1, │ │ │ │ │ "37": 7, │ │ │ │ │ - "3796044": 8, │ │ │ │ │ + "37091202": 8, │ │ │ │ │ "38": 7, │ │ │ │ │ "39": 7, │ │ │ │ │ "3d": 20, │ │ │ │ │ "4": [7, 8, 14, 15, 18, 21], │ │ │ │ │ "40": 7, │ │ │ │ │ "400": [8, 15], │ │ │ │ │ "41": 7, │ │ │ │ │ + "4191816": 8, │ │ │ │ │ + "42677975": 8, │ │ │ │ │ "43": 7, │ │ │ │ │ + "43195474": 8, │ │ │ │ │ + "43797806": 8, │ │ │ │ │ "44": 7, │ │ │ │ │ - "44213656": 8, │ │ │ │ │ + "44480878": 8, │ │ │ │ │ "45": 7, │ │ │ │ │ - "453243": 8, │ │ │ │ │ + "4538345": 8, │ │ │ │ │ "46": 7, │ │ │ │ │ "47": 7, │ │ │ │ │ - "47321656": 8, │ │ │ │ │ "48": 7, │ │ │ │ │ + "48208618": 8, │ │ │ │ │ "49": 7, │ │ │ │ │ - "4972064": 8, │ │ │ │ │ + "4967294": 8, │ │ │ │ │ "5": [7, 8, 14, 15, 19], │ │ │ │ │ "50": 7, │ │ │ │ │ "500": [8, 15], │ │ │ │ │ - "505034": 8, │ │ │ │ │ - "50547403": 8, │ │ │ │ │ "51": 7, │ │ │ │ │ - "5139418": 8, │ │ │ │ │ "52": 7, │ │ │ │ │ - "52570784": 8, │ │ │ │ │ "53": [0, 7], │ │ │ │ │ + "5352891": 8, │ │ │ │ │ "54": 7, │ │ │ │ │ + "5459706": 8, │ │ │ │ │ "55": 7, │ │ │ │ │ - "55443": 8, │ │ │ │ │ "56": 7, │ │ │ │ │ - "56937736": 8, │ │ │ │ │ + "5673919": 8, │ │ │ │ │ "57": 7, │ │ │ │ │ "58": 7, │ │ │ │ │ - "5820385": 8, │ │ │ │ │ - "5821638": 8, │ │ │ │ │ - "5891389": 8, │ │ │ │ │ "59": 7, │ │ │ │ │ - "5944673": 8, │ │ │ │ │ "6": [7, 8, 14, 15], │ │ │ │ │ "60": 7, │ │ │ │ │ "600": [8, 15], │ │ │ │ │ + "6079317": 8, │ │ │ │ │ "61": 7, │ │ │ │ │ "610": 8, │ │ │ │ │ - "6147773": 8, │ │ │ │ │ + "6105821": 8, │ │ │ │ │ + "6186649": 8, │ │ │ │ │ "62": 7, │ │ │ │ │ "626": 7, │ │ │ │ │ + "6268418": 8, │ │ │ │ │ "63": [0, 6], │ │ │ │ │ "64": [0, 6, 11], │ │ │ │ │ - "6490232": 8, │ │ │ │ │ + "6460697": 8, │ │ │ │ │ "65535": 6, │ │ │ │ │ - "6588702": 8, │ │ │ │ │ + "65923005": 8, │ │ │ │ │ + "68172616": 8, │ │ │ │ │ "6x1": 18, │ │ │ │ │ "7": [7, 8, 14, 15, 19], │ │ │ │ │ "70": 14, │ │ │ │ │ "700": [8, 15], │ │ │ │ │ - "71070987": 8, │ │ │ │ │ + "7122107": 8, │ │ │ │ │ "739": 14, │ │ │ │ │ - "7429908": 8, │ │ │ │ │ - "74552315": 8, │ │ │ │ │ "752": 14, │ │ │ │ │ - "78359914": 8, │ │ │ │ │ - "78381735": 8, │ │ │ │ │ + "7550921": 8, │ │ │ │ │ + "7627266": 8, │ │ │ │ │ + "7662494": 8, │ │ │ │ │ + "782354": 8, │ │ │ │ │ "785": 8, │ │ │ │ │ "786": 8, │ │ │ │ │ "787": 8, │ │ │ │ │ "789": 8, │ │ │ │ │ - "79213": 8, │ │ │ │ │ "8": [0, 7, 8, 14, 15, 18, 19], │ │ │ │ │ "80": [6, 14, 21], │ │ │ │ │ "800": [8, 15], │ │ │ │ │ - "8053516": 8, │ │ │ │ │ - "80676115": 8, │ │ │ │ │ - "81767064": 8, │ │ │ │ │ + "8040645": 8, │ │ │ │ │ + "8208881": 8, │ │ │ │ │ "84": 7, │ │ │ │ │ - "85034865": 8, │ │ │ │ │ - "8565489": 8, │ │ │ │ │ + "8545378": 8, │ │ │ │ │ + "8669989": 8, │ │ │ │ │ "9": [7, 8, 11, 14, 15], │ │ │ │ │ "90": 14, │ │ │ │ │ "900": [8, 15], │ │ │ │ │ - "903661": 8, │ │ │ │ │ - "9411819": 8, │ │ │ │ │ + "9001247": 8, │ │ │ │ │ + "90122086": 8, │ │ │ │ │ + "9362271": 8, │ │ │ │ │ "97": 7, │ │ │ │ │ - "97170377": 8, │ │ │ │ │ - "98979634": 8, │ │ │ │ │ - "99203366": 8, │ │ │ │ │ - "9989154": 8, │ │ │ │ │ + "98105085": 8, │ │ │ │ │ + "9852199": 8, │ │ │ │ │ "A": [0, 5, 6, 8, 9, 12, 18, 19], │ │ │ │ │ "AND": 12, │ │ │ │ │ "AS": 12, │ │ │ │ │ "As": 15, │ │ │ │ │ "BE": 12, │ │ │ │ │ "BUT": 12, │ │ │ │ │ "BY": 12,