--- /srv/reproducible-results/rbuild-debian/r-b-build.kGCIYpGH/b1/r-bioc-genomicfeatures_1.58.0+dfsg-2_arm64.changes
+++ /srv/reproducible-results/rbuild-debian/r-b-build.kGCIYpGH/b2/r-bioc-genomicfeatures_1.58.0+dfsg-2_arm64.changes
├── Files
│ @@ -1,2 +1,2 @@
│  
│ - aa7828e5278b52e6835317e0376befc0 931788 gnu-r optional r-bioc-genomicfeatures_1.58.0+dfsg-2_all.deb
│ + 9097f06edabd969d04cbd8105f8ceab9 932036 gnu-r optional r-bioc-genomicfeatures_1.58.0+dfsg-2_all.deb
├── r-bioc-genomicfeatures_1.58.0+dfsg-2_all.deb
│ ├── file list
│ │ @@ -1,3 +1,3 @@
│ │  -rw-r--r--   0        0        0        4 2025-01-13 20:12:39.000000 debian-binary
│ │  -rw-r--r--   0        0        0     2400 2025-01-13 20:12:39.000000 control.tar.xz
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│ │ +-rw-r--r--   0        0        0   929444 2025-01-13 20:12:39.000000 data.tar.xz
│ ├── control.tar.xz
│ │ ├── control.tar
│ │ │ ├── ./md5sums
│ │ │ │ ├── ./md5sums
│ │ │ │ │┄ Files differ
│ ├── data.tar.xz
│ │ ├── data.tar
│ │ │ ├── file list
│ │ │ │ @@ -20,16 +20,16 @@
│ │ │ │  drwxr-xr-x   0 root         (0) root         (0)        0 2025-01-13 20:12:39.000000 ./usr/lib/R/site-library/GenomicFeatures/R/
│ │ │ │  -rw-r--r--   0 root         (0) root         (0)     1058 2025-01-13 20:12:39.000000 ./usr/lib/R/site-library/GenomicFeatures/R/GenomicFeatures
│ │ │ │  -rw-r--r--   0 root         (0) root         (0)   887000 2025-01-13 20:12:39.000000 ./usr/lib/R/site-library/GenomicFeatures/R/GenomicFeatures.rdb
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│ │ │ │  drwxr-xr-x   0 root         (0) root         (0)        0 2025-01-13 20:12:39.000000 ./usr/lib/R/site-library/GenomicFeatures/doc/
│ │ │ │  -rw-r--r--   0 root         (0) root         (0)     3968 2025-01-13 20:12:39.000000 ./usr/lib/R/site-library/GenomicFeatures/doc/GenomicFeatures.R
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│ │ │ │ --rw-r--r--   0 root         (0) root         (0)    17795 2025-01-13 20:12:39.000000 ./usr/lib/R/site-library/GenomicFeatures/doc/GenomicFeatures.md
│ │ │ │ +-rw-r--r--   0 root         (0) root         (0)    25947 2025-01-13 20:12:39.000000 ./usr/lib/R/site-library/GenomicFeatures/doc/GenomicFeatures.html
│ │ │ │ +-rw-r--r--   0 root         (0) root         (0)    17796 2025-01-13 20:12:39.000000 ./usr/lib/R/site-library/GenomicFeatures/doc/GenomicFeatures.md
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│ │ │ │  drwxr-xr-x   0 root         (0) root         (0)        0 2025-01-13 20:12:39.000000 ./usr/lib/R/site-library/GenomicFeatures/extdata/
│ │ │ │  -rw-r--r--   0 root         (0) root         (0)    45056 2025-01-13 20:12:39.000000 ./usr/lib/R/site-library/GenomicFeatures/extdata/Biomart_Ensembl_sample.sqlite
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│ │ │ │  -rw-r--r--   0 root         (0) root         (0)     9684 2025-01-13 20:12:39.000000 ./usr/lib/R/site-library/GenomicFeatures/extdata/ITAG4.1_gene_models.subset.gff
│ │ │ │  -rw-r--r--   0 root         (0) root         (0)   111616 2025-01-13 20:12:39.000000 ./usr/lib/R/site-library/GenomicFeatures/extdata/hg19_knownGene_sample.sqlite
│ │ │ │  -rw-r--r--   0 root         (0) root         (0)     6490 2025-01-13 20:12:39.000000 ./usr/lib/R/site-library/GenomicFeatures/extdata/sample_ranges.rds
│ │ │ ├── ./usr/lib/R/site-library/GenomicFeatures/doc/GenomicFeatures.html
│ │ │ │ @@ -142,15 +142,15 @@
│ │ │ │  <div class="frontmatter">
│ │ │ │  <div class="title"><h1>Obtaining and Utilizing TxDb Objects</h1></div>
│ │ │ │  <div class="author"><h2>list(name = “Marc Carlson”)
│ │ │ │  list(name = “Patrick Aboyoun”)
│ │ │ │  list(name = “Herv&lt;U+00E9&gt; Pag&lt;U+00E8&gt;s”)
│ │ │ │  list(name = “Seth Falcon”)
│ │ │ │  list(name = “Martin Morgan”)</h2></div>
│ │ │ │ -<div class="date"><h3>Wednesday, January 15, 2025</h3></div>
│ │ │ │ +<div class="date"><h3>Wednesday, February 18, 2026</h3></div>
│ │ │ │  </div>
│ │ │ │  <div class="body">
│ │ │ │  <h1 id="introduction">Introduction</h1>
│ │ │ │  <p>The <code>GenomicFeatures</code> package implements the <code>TxDb</code> container for
│ │ │ │  storing transcript metadata for a given organism. A <code>TxDb</code> object
│ │ │ │  stores the genomic positions of the 5’ and 3’ untranslated regions
│ │ │ │  (UTRs), protein coding sequences (CDSs), and exons for a set of mRNA
│ │ │ │ @@ -563,15 +563,15 @@
│ │ │ │  ## Matrix products: default
│ │ │ │  ## BLAS:   /usr/lib/aarch64-linux-gnu/blas/libblas.so.3.12.0 
│ │ │ │  ## LAPACK: /usr/lib/aarch64-linux-gnu/lapack/liblapack.so.3.12.0
│ │ │ │  ## 
│ │ │ │  ## locale:
│ │ │ │  ## [1] C
│ │ │ │  ## 
│ │ │ │ -## time zone: /usr/share/zoneinfo/Etc/GMT+12
│ │ │ │ +## time zone: /usr/share/zoneinfo/Etc/GMT-14
│ │ │ │  ## tzcode source: system (glibc)
│ │ │ │  ## 
│ │ │ │  ## attached base packages:
│ │ │ │  ## [1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base     
│ │ │ │  ## 
│ │ │ │  ## other attached packages:
│ │ │ │  ## [1] markdown_1.12 knitr_1.49
│ │ │ │ ├── html2text {}
│ │ │ │ │ @@ -1,12 +1,12 @@
│ │ │ │ │  ************ OObbttaaiinniinngg aanndd UUttiilliizziinngg TTxxDDbb OObbjjeeccttss ************
│ │ │ │ │  ********** lliisstt((nnaammee == ?“MMaarrcc CCaarrllssoonn?”)) lliisstt((nnaammee == ?“PPaattrriicckk AAbbooyyoouunn?”)) lliisstt((nnaammee ==
│ │ │ │ │  ?“HHeerrvv<<UU++0000EE99>> PPaagg<<UU++0000EE88>>ss?”)) lliisstt((nnaammee == ?“SSeetthh FFaallccoonn?”)) lliisstt((nnaammee == ?“MMaarrttiinn
│ │ │ │ │  MMoorrggaann?”)) **********
│ │ │ │ │ -******** WWeeddnneessddaayy,, JJaannuuaarryy 1155,, 22002255 ********
│ │ │ │ │ +******** WWeeddnneessddaayy,, FFeebbrruuaarryy 1188,, 22002266 ********
│ │ │ │ │  ************ IInnttrroodduuccttiioonn ************
│ │ │ │ │  The GenomicFeatures package implements the TxDb container for storing
│ │ │ │ │  transcript metadata for a given organism. A TxDb object stores the genomic
│ │ │ │ │  positions of the 5’ and 3’ untranslated regions (UTRs), protein coding
│ │ │ │ │  sequences (CDSs), and exons for a set of mRNA transcripts. The genomic
│ │ │ │ │  positions are stored and reported with respect to a given genome assembly. TxDb
│ │ │ │ │  objects have numerous accessors functions to allow such features to be
│ │ │ │ │ @@ -290,15 +290,15 @@
│ │ │ │ │  ## Matrix products: default
│ │ │ │ │  ## BLAS:   /usr/lib/aarch64-linux-gnu/blas/libblas.so.3.12.0
│ │ │ │ │  ## LAPACK: /usr/lib/aarch64-linux-gnu/lapack/liblapack.so.3.12.0
│ │ │ │ │  ##
│ │ │ │ │  ## locale:
│ │ │ │ │  ## [1] C
│ │ │ │ │  ##
│ │ │ │ │ -## time zone: /usr/share/zoneinfo/Etc/GMT+12
│ │ │ │ │ +## time zone: /usr/share/zoneinfo/Etc/GMT-14
│ │ │ │ │  ## tzcode source: system (glibc)
│ │ │ │ │  ##
│ │ │ │ │  ## attached base packages:
│ │ │ │ │  ## [1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base
│ │ │ │ │  ##
│ │ │ │ │  ## other attached packages:
│ │ │ │ │  ## [1] markdown_1.12 knitr_1.49
│ │ │ ├── ./usr/lib/R/site-library/GenomicFeatures/doc/GenomicFeatures.md
│ │ │ │ @@ -2,15 +2,15 @@
│ │ │ │  title: "Obtaining and Utilizing TxDb Objects"
│ │ │ │  author:
│ │ │ │  - name: Marc Carlson
│ │ │ │  - name: Patrick Aboyoun
│ │ │ │  - name: Hervé Pagès
│ │ │ │  - name: Seth Falcon
│ │ │ │  - name: Martin Morgan
│ │ │ │ -date: "Wednesday, January 15, 2025"
│ │ │ │ +date: "Wednesday, February 18, 2026"
│ │ │ │  package: GenomicFeatures
│ │ │ │  vignette: |
│ │ │ │    %\VignetteIndexEntry{Obtaining and Utilizing TxDb Objects}
│ │ │ │    %\VignetteEngine{knitr::rmarkdown}
│ │ │ │    %\VignetteEncoding{UTF-8}
│ │ │ │    %\VignetteDepends{GenomicFeatures,TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19}
│ │ │ │    %\VignetteKeywords{annotation, database}
│ │ │ │ @@ -732,15 +732,15 @@
│ │ │ │  ## Matrix products: default
│ │ │ │  ## BLAS:   /usr/lib/aarch64-linux-gnu/blas/libblas.so.3.12.0 
│ │ │ │  ## LAPACK: /usr/lib/aarch64-linux-gnu/lapack/liblapack.so.3.12.0
│ │ │ │  ## 
│ │ │ │  ## locale:
│ │ │ │  ## [1] C
│ │ │ │  ## 
│ │ │ │ -## time zone: /usr/share/zoneinfo/Etc/GMT+12
│ │ │ │ +## time zone: /usr/share/zoneinfo/Etc/GMT-14
│ │ │ │  ## tzcode source: system (glibc)
│ │ │ │  ## 
│ │ │ │  ## attached base packages:
│ │ │ │  ## [1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base     
│ │ │ │  ## 
│ │ │ │  ## other attached packages:
│ │ │ │  ## [1] markdown_1.12 knitr_1.49