--- /srv/reproducible-results/rbuild-debian/r-b-build.doDDECa1/b1/python-gsd_3.3.0-1_amd64.changes
+++ /srv/reproducible-results/rbuild-debian/r-b-build.doDDECa1/b2/python-gsd_3.3.0-1_amd64.changes
├── Files
│ @@ -1,4 +1,4 @@
│
│ - a31296783a5dca7e7c4b488637c6ef0e 130404 doc optional python-gsd-doc_3.3.0-1_all.deb
│ + eb7582480d88120c266d06b33b214ed1 130380 doc optional python-gsd-doc_3.3.0-1_all.deb
│ 1f41d330e29a65b0905e65b0574b6c68 352380 debug optional python3-gsd-dbgsym_3.3.0-1_amd64.deb
│ 6f6645682d7159ca7fca5d0b4640cd50 201020 python optional python3-gsd_3.3.0-1_amd64.deb
├── python-gsd-doc_3.3.0-1_all.deb
│ ├── file list
│ │ @@ -1,3 +1,3 @@
│ │ -rw-r--r-- 0 0 0 4 2024-07-05 16:19:20.000000 debian-binary
│ │ -rw-r--r-- 0 0 0 2692 2024-07-05 16:19:20.000000 control.tar.xz
│ │ --rw-r--r-- 0 0 0 127520 2024-07-05 16:19:20.000000 data.tar.xz
│ │ +-rw-r--r-- 0 0 0 127496 2024-07-05 16:19:20.000000 data.tar.xz
│ ├── control.tar.xz
│ │ ├── control.tar
│ │ │ ├── ./md5sums
│ │ │ │ ├── ./md5sums
│ │ │ │ │┄ Files differ
│ ├── data.tar.xz
│ │ ├── data.tar
│ │ │ ├── file list
│ │ │ │ @@ -71,15 +71,15 @@
│ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 23394 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/python-api.html
│ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 87526 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/python-module-gsd.fl.html
│ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 95472 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/python-module-gsd.hoomd.html
│ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 49307 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/python-module-gsd.pygsd.html
│ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 18756 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/python-module-gsd.version.html
│ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 107555 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/schema-hoomd.html
│ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 16660 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/search.html
│ │ │ │ --rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 82718 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/searchindex.js
│ │ │ │ +-rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 82720 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/searchindex.js
│ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 32666 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/shapes.html
│ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 20804 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/specification.html
│ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 24988 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/style.html
│ │ │ │ drwxr-xr-x 0 root (0) root (0) 0 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc-base/
│ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 331 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc-base/python-gsd-doc.python-gsd
│ │ │ │ lrwxrwxrwx 0 root (0) root (0) 0 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/_static/doctools.js -> ../../../../javascript/sphinxdoc/1.0/doctools.js
│ │ │ │ lrwxrwxrwx 0 root (0) root (0) 0 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/_static/language_data.js -> ../../../../javascript/sphinxdoc/1.0/language_data.js
│ │ │ ├── ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/hoomd-examples.html
│ │ │ │ @@ -355,23 +355,23 @@
│ │ │ │ Out[16]: 5
│ │ │ │
│ │ │ │ In [17]: frame.particles.N
│ │ │ │ Out[17]: 9
│ │ │ │
│ │ │ │ In [18]: frame.particles.position
│ │ │ │ Out[18]:
│ │ │ │ -array([[0.98634994, 0.2609803 , 0.7573276 ],
│ │ │ │ - [0.72124755, 0.17434151, 0.9312099 ],
│ │ │ │ - [0.30205306, 0.8568594 , 0.27031362],
│ │ │ │ - [0.24807246, 0.33414975, 0.694913 ],
│ │ │ │ - [0.9600695 , 0.4758474 , 0.3320576 ],
│ │ │ │ - [0.961259 , 0.9022375 , 0.9067115 ],
│ │ │ │ - [0.11638785, 0.48132548, 0.31074518],
│ │ │ │ - [0.36147836, 0.5054218 , 0.5500284 ],
│ │ │ │ - [0.43136147, 0.0093628 , 0.35895073]], dtype=float32)
│ │ │ │ +array([[0.7728585 , 0.6417677 , 0.6185172 ],
│ │ │ │ + [0.31226304, 0.42622846, 0.12717864],
│ │ │ │ + [0.6962113 , 0.891335 , 0.2346277 ],
│ │ │ │ + [0.74645686, 0.43528122, 0.8094549 ],
│ │ │ │ + [0.39409447, 0.30772775, 0.88995653],
│ │ │ │ + [0.02269289, 0.47618988, 0.20087525],
│ │ │ │ + [0.7403571 , 0.57417494, 0.5038097 ],
│ │ │ │ + [0.24330384, 0.72416556, 0.59850305],
│ │ │ │ + [0.43724802, 0.15415701, 0.8006849 ]], dtype=float32)
│ │ │ │
│ │ │ │
│ │ │ │
gsd.hoomd.HOOMDTrajectory
supports random indexing of frames in the file.
│ │ │ │ Indexing into a trajectory returns a gsd.hoomd.Frame
.
│ │ │ │
│ │ │ │
│ │ │ │ Slicing and selection
│ │ │ │ @@ -398,21 +398,21 @@
│ │ │ │ Pure python reader
│ │ │ │ In [23]: f = gsd.pygsd.GSDFile(open('example.gsd', 'rb'))
│ │ │ │
│ │ │ │ In [24]: trajectory = gsd.hoomd.HOOMDTrajectory(f);
│ │ │ │
│ │ │ │ In [25]: trajectory[3].particles.position
│ │ │ │ Out[25]:
│ │ │ │ -array([[0.89297575, 0.60751784, 0.39828512],
│ │ │ │ - [0.3539692 , 0.84396565, 0.86274457],
│ │ │ │ - [0.25198603, 0.83817095, 0.79711986],
│ │ │ │ - [0.14295614, 0.7289324 , 0.81089723],
│ │ │ │ - [0.9579095 , 0.04793588, 0.95506656],
│ │ │ │ - [0.22937089, 0.3427639 , 0.7957847 ],
│ │ │ │ - [0.48885173, 0.83030915, 0.34693772]], dtype=float32)
│ │ │ │ +array([[0.86071503, 0.8684962 , 0.8524982 ],
│ │ │ │ + [0.00260618, 0.7631574 , 0.2306025 ],
│ │ │ │ + [0.63282514, 0.05476646, 0.2705843 ],
│ │ │ │ + [0.08640291, 0.2560719 , 0.90849054],
│ │ │ │ + [0.8191478 , 0.10490891, 0.5575511 ],
│ │ │ │ + [0.16042605, 0.30859837, 0.19020057],
│ │ │ │ + [0.01083884, 0.48338255, 0.35933688]], dtype=float32)
│ │ │ │
│ │ │ │
│ │ │ │ You can use GSD without needing to compile C code to read GSD files
│ │ │ │ using gsd.pygsd.GSDFile
in combination with gsd.hoomd.HOOMDTrajectory
. It
│ │ │ │ only supports the rb
mode and does not read files as fast as the C
│ │ │ │ implementation. It takes in a python file-like object, so it can be used with
│ │ │ │ in-memory IO classes, and grid file classes that access data over the internet.
│ │ │ │ ├── html2text {}
│ │ │ │ │ @@ -95,23 +95,23 @@
│ │ │ │ │ Out[16]: 5
│ │ │ │ │
│ │ │ │ │ In [17]: frame.particles.N
│ │ │ │ │ Out[17]: 9
│ │ │ │ │
│ │ │ │ │ In [18]: frame.particles.position
│ │ │ │ │ Out[18]:
│ │ │ │ │ -array([[0.98634994, 0.2609803 , 0.7573276 ],
│ │ │ │ │ - [0.72124755, 0.17434151, 0.9312099 ],
│ │ │ │ │ - [0.30205306, 0.8568594 , 0.27031362],
│ │ │ │ │ - [0.24807246, 0.33414975, 0.694913 ],
│ │ │ │ │ - [0.9600695 , 0.4758474 , 0.3320576 ],
│ │ │ │ │ - [0.961259 , 0.9022375 , 0.9067115 ],
│ │ │ │ │ - [0.11638785, 0.48132548, 0.31074518],
│ │ │ │ │ - [0.36147836, 0.5054218 , 0.5500284 ],
│ │ │ │ │ - [0.43136147, 0.0093628 , 0.35895073]], dtype=float32)
│ │ │ │ │ +array([[0.7728585 , 0.6417677 , 0.6185172 ],
│ │ │ │ │ + [0.31226304, 0.42622846, 0.12717864],
│ │ │ │ │ + [0.6962113 , 0.891335 , 0.2346277 ],
│ │ │ │ │ + [0.74645686, 0.43528122, 0.8094549 ],
│ │ │ │ │ + [0.39409447, 0.30772775, 0.88995653],
│ │ │ │ │ + [0.02269289, 0.47618988, 0.20087525],
│ │ │ │ │ + [0.7403571 , 0.57417494, 0.5038097 ],
│ │ │ │ │ + [0.24330384, 0.72416556, 0.59850305],
│ │ │ │ │ + [0.43724802, 0.15415701, 0.8006849 ]], dtype=float32)
│ │ │ │ │ _g_s_d_._h_o_o_m_d_._H_O_O_M_D_T_r_a_j_e_c_t_o_r_y supports random indexing of frames in the file.
│ │ │ │ │ Indexing into a trajectory returns a _g_s_d_._h_o_o_m_d_._F_r_a_m_e.
│ │ │ │ │ ********** SSlliicciinngg aanndd sseelleeccttiioonn_?¶ **********
│ │ │ │ │ Use the slicing operator to select individual frames or a subset of a
│ │ │ │ │ trajectory.
│ │ │ │ │ In [19]: f = gsd.hoomd.open(name='example.gsd', mode='r')
│ │ │ │ │
│ │ │ │ │ @@ -130,21 +130,21 @@
│ │ │ │ │ ********** PPuurree ppyytthhoonn rreeaaddeerr_?¶ **********
│ │ │ │ │ In [23]: f = gsd.pygsd.GSDFile(open('example.gsd', 'rb'))
│ │ │ │ │
│ │ │ │ │ In [24]: trajectory = gsd.hoomd.HOOMDTrajectory(f);
│ │ │ │ │
│ │ │ │ │ In [25]: trajectory[3].particles.position
│ │ │ │ │ Out[25]:
│ │ │ │ │ -array([[0.89297575, 0.60751784, 0.39828512],
│ │ │ │ │ - [0.3539692 , 0.84396565, 0.86274457],
│ │ │ │ │ - [0.25198603, 0.83817095, 0.79711986],
│ │ │ │ │ - [0.14295614, 0.7289324 , 0.81089723],
│ │ │ │ │ - [0.9579095 , 0.04793588, 0.95506656],
│ │ │ │ │ - [0.22937089, 0.3427639 , 0.7957847 ],
│ │ │ │ │ - [0.48885173, 0.83030915, 0.34693772]], dtype=float32)
│ │ │ │ │ +array([[0.86071503, 0.8684962 , 0.8524982 ],
│ │ │ │ │ + [0.00260618, 0.7631574 , 0.2306025 ],
│ │ │ │ │ + [0.63282514, 0.05476646, 0.2705843 ],
│ │ │ │ │ + [0.08640291, 0.2560719 , 0.90849054],
│ │ │ │ │ + [0.8191478 , 0.10490891, 0.5575511 ],
│ │ │ │ │ + [0.16042605, 0.30859837, 0.19020057],
│ │ │ │ │ + [0.01083884, 0.48338255, 0.35933688]], dtype=float32)
│ │ │ │ │ You can use GGSSDD without needing to compile C code to read GGSSDD files using
│ │ │ │ │ _g_s_d_._p_y_g_s_d_._G_S_D_F_i_l_e in combination with _g_s_d_._h_o_o_m_d_._H_O_O_M_D_T_r_a_j_e_c_t_o_r_y. It only
│ │ │ │ │ supports the rb mode and does not read files as fast as the C implementation.
│ │ │ │ │ It takes in a python file-like object, so it can be used with in-memory IO
│ │ │ │ │ classes, and grid file classes that access data over the internet.
│ │ │ │ │ Warning
│ │ │ │ │ _g_s_d_._p_y_g_s_d is ssllooww. Use _g_s_d_._h_o_o_m_d_._o_p_e_n whenever possible.
│ │ │ ├── ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/searchindex.js
│ │ │ │ ├── js-beautify {}
│ │ │ │ │ @@ -1870,189 +1870,189 @@
│ │ │ │ │ "12": "py:property",
│ │ │ │ │ "13": "std:chunk",
│ │ │ │ │ "14": "std:cmdoption"
│ │ │ │ │ },
│ │ │ │ │ "terms": {
│ │ │ │ │ "": [1, 2, 3, 7, 8, 11, 13, 14, 18, 21],
│ │ │ │ │ "0": [0, 6, 7, 8, 11, 14, 15, 16, 18, 19],
│ │ │ │ │ - "0093628": 8,
│ │ │ │ │ - "04793588": 8,
│ │ │ │ │ + "00260618": 8,
│ │ │ │ │ + "01083884": 8,
│ │ │ │ │ + "02269289": 8,
│ │ │ │ │ + "05476646": 8,
│ │ │ │ │ + "08640291": 8,
│ │ │ │ │ "0x65df65df65df65df": 6,
│ │ │ │ │ "0xaaaabbbb": 6,
│ │ │ │ │ "1": [0, 6, 7, 8, 11, 12, 14, 15, 16, 18, 19],
│ │ │ │ │ "10": [7, 8, 11, 14, 15],
│ │ │ │ │ "100": [8, 15, 21],
│ │ │ │ │ "103": 7,
│ │ │ │ │ "104": 7,
│ │ │ │ │ + "10490891": 8,
│ │ │ │ │ "105": 7,
│ │ │ │ │ "11": [7, 8, 14, 21],
│ │ │ │ │ "110": 7,
│ │ │ │ │ "114": 7,
│ │ │ │ │ "115": 7,
│ │ │ │ │ "116": 7,
│ │ │ │ │ - "11638785": 8,
│ │ │ │ │ "12": [7, 8, 14],
│ │ │ │ │ "127": 1,
│ │ │ │ │ + "12717864": 8,
│ │ │ │ │ "12_gsd": [7, 8, 14],
│ │ │ │ │ "13": [7, 8, 14],
│ │ │ │ │ "14": [7, 8, 11, 14],
│ │ │ │ │ - "14295614": 8,
│ │ │ │ │ "15": [7, 8, 14],
│ │ │ │ │ + "15415701": 8,
│ │ │ │ │ "16": [0, 6, 7, 8, 14],
│ │ │ │ │ + "16042605": 8,
│ │ │ │ │ "17": [7, 8, 14],
│ │ │ │ │ - "17434151": 8,
│ │ │ │ │ "18": [7, 8, 11],
│ │ │ │ │ "19": [7, 8, 11, 14],
│ │ │ │ │ + "19020057": 8,
│ │ │ │ │ "1d": [14, 16],
│ │ │ │ │ "1x1": [18, 19],
│ │ │ │ │ "2": [0, 6, 7, 8, 12, 14, 15, 16, 18, 19],
│ │ │ │ │ "20": [7, 8],
│ │ │ │ │ "200": [8, 15],
│ │ │ │ │ + "20087525": 8,
│ │ │ │ │ "2016": 12,
│ │ │ │ │ "2019": 11,
│ │ │ │ │ "2022": 11,
│ │ │ │ │ "2024": 12,
│ │ │ │ │ "21": [7, 8],
│ │ │ │ │ "22": [7, 8, 11],
│ │ │ │ │ - "22937089": 8,
│ │ │ │ │ "23": [7, 8],
│ │ │ │ │ + "2306025": 8,
│ │ │ │ │ + "2346277": 8,
│ │ │ │ │ "235": 1,
│ │ │ │ │ "237": 1,
│ │ │ │ │ "238": 1,
│ │ │ │ │ "24": [7, 8],
│ │ │ │ │ - "24807246": 8,
│ │ │ │ │ + "24330384": 8,
│ │ │ │ │ "249": 1,
│ │ │ │ │ "25": [7, 8],
│ │ │ │ │ - "25198603": 8,
│ │ │ │ │ "255": 1,
│ │ │ │ │ "256": [0, 6],
│ │ │ │ │ + "2560719": 8,
│ │ │ │ │ "257": 1,
│ │ │ │ │ "26": [7, 8],
│ │ │ │ │ - "2609803": 8,
│ │ │ │ │ "266": 1,
│ │ │ │ │ "267": 1,
│ │ │ │ │ "27": [7, 8],
│ │ │ │ │ "270": 1,
│ │ │ │ │ - "27031362": 8,
│ │ │ │ │ + "2705843": 8,
│ │ │ │ │ "28": [7, 8],
│ │ │ │ │ "283": 1,
│ │ │ │ │ "29": [7, 8],
│ │ │ │ │ "2d": [14, 16, 18, 19],
│ │ │ │ │ "2gib": 1,
│ │ │ │ │ "3": [7, 8, 11, 14, 15, 16, 18, 19],
│ │ │ │ │ "30": [7, 8],
│ │ │ │ │ "300": [8, 15],
│ │ │ │ │ - "30205306": 8,
│ │ │ │ │ + "30772775": 8,
│ │ │ │ │ "308": 1,
│ │ │ │ │ + "30859837": 8,
│ │ │ │ │ "31": [7, 8],
│ │ │ │ │ - "31074518": 8,
│ │ │ │ │ + "31226304": 8,
│ │ │ │ │ "317": 1,
│ │ │ │ │ "319": 1,
│ │ │ │ │ "32": [0, 6, 7, 18],
│ │ │ │ │ "322": 1,
│ │ │ │ │ "323": 1,
│ │ │ │ │ "324": 1,
│ │ │ │ │ "325": 1,
│ │ │ │ │ "33": 7,
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