--- /srv/reproducible-results/rbuild-debian/r-b-build.doDDECa1/b1/python-gsd_3.3.0-1_amd64.changes +++ /srv/reproducible-results/rbuild-debian/r-b-build.doDDECa1/b2/python-gsd_3.3.0-1_amd64.changes ├── Files │ @@ -1,4 +1,4 @@ │ │ - a31296783a5dca7e7c4b488637c6ef0e 130404 doc optional python-gsd-doc_3.3.0-1_all.deb │ + eb7582480d88120c266d06b33b214ed1 130380 doc optional python-gsd-doc_3.3.0-1_all.deb │ 1f41d330e29a65b0905e65b0574b6c68 352380 debug optional python3-gsd-dbgsym_3.3.0-1_amd64.deb │ 6f6645682d7159ca7fca5d0b4640cd50 201020 python optional python3-gsd_3.3.0-1_amd64.deb ├── python-gsd-doc_3.3.0-1_all.deb │ ├── file list │ │ @@ -1,3 +1,3 @@ │ │ -rw-r--r-- 0 0 0 4 2024-07-05 16:19:20.000000 debian-binary │ │ -rw-r--r-- 0 0 0 2692 2024-07-05 16:19:20.000000 control.tar.xz │ │ --rw-r--r-- 0 0 0 127520 2024-07-05 16:19:20.000000 data.tar.xz │ │ +-rw-r--r-- 0 0 0 127496 2024-07-05 16:19:20.000000 data.tar.xz │ ├── control.tar.xz │ │ ├── control.tar │ │ │ ├── ./md5sums │ │ │ │ ├── ./md5sums │ │ │ │ │┄ Files differ │ ├── data.tar.xz │ │ ├── data.tar │ │ │ ├── file list │ │ │ │ @@ -71,15 +71,15 @@ │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 23394 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/python-api.html │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 87526 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/python-module-gsd.fl.html │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 95472 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/python-module-gsd.hoomd.html │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 49307 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/python-module-gsd.pygsd.html │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 18756 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/python-module-gsd.version.html │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 107555 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/schema-hoomd.html │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 16660 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/search.html │ │ │ │ --rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 82718 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/searchindex.js │ │ │ │ +-rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 82720 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/searchindex.js │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 32666 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/shapes.html │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 20804 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/specification.html │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 24988 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/style.html │ │ │ │ drwxr-xr-x 0 root (0) root (0) 0 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc-base/ │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 331 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc-base/python-gsd-doc.python-gsd │ │ │ │ lrwxrwxrwx 0 root (0) root (0) 0 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/_static/doctools.js -> ../../../../javascript/sphinxdoc/1.0/doctools.js │ │ │ │ lrwxrwxrwx 0 root (0) root (0) 0 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/_static/language_data.js -> ../../../../javascript/sphinxdoc/1.0/language_data.js │ │ │ ├── ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/hoomd-examples.html │ │ │ │ @@ -355,23 +355,23 @@ │ │ │ │ Out[16]: 5 │ │ │ │ │ │ │ │ In [17]: frame.particles.N │ │ │ │ Out[17]: 9 │ │ │ │ │ │ │ │ In [18]: frame.particles.position │ │ │ │ Out[18]: │ │ │ │ -array([[0.98634994, 0.2609803 , 0.7573276 ], │ │ │ │ - [0.72124755, 0.17434151, 0.9312099 ], │ │ │ │ - [0.30205306, 0.8568594 , 0.27031362], │ │ │ │ - [0.24807246, 0.33414975, 0.694913 ], │ │ │ │ - [0.9600695 , 0.4758474 , 0.3320576 ], │ │ │ │ - [0.961259 , 0.9022375 , 0.9067115 ], │ │ │ │ - [0.11638785, 0.48132548, 0.31074518], │ │ │ │ - [0.36147836, 0.5054218 , 0.5500284 ], │ │ │ │ - [0.43136147, 0.0093628 , 0.35895073]], dtype=float32) │ │ │ │ +array([[0.7728585 , 0.6417677 , 0.6185172 ], │ │ │ │ + [0.31226304, 0.42622846, 0.12717864], │ │ │ │ + [0.6962113 , 0.891335 , 0.2346277 ], │ │ │ │ + [0.74645686, 0.43528122, 0.8094549 ], │ │ │ │ + [0.39409447, 0.30772775, 0.88995653], │ │ │ │ + [0.02269289, 0.47618988, 0.20087525], │ │ │ │ + [0.7403571 , 0.57417494, 0.5038097 ], │ │ │ │ + [0.24330384, 0.72416556, 0.59850305], │ │ │ │ + [0.43724802, 0.15415701, 0.8006849 ]], dtype=float32) │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ │

gsd.hoomd.HOOMDTrajectory supports random indexing of frames in the file. │ │ │ │ Indexing into a trajectory returns a gsd.hoomd.Frame.

│ │ │ │ │ │ │ │
│ │ │ │

Slicing and selection

│ │ │ │ @@ -398,21 +398,21 @@ │ │ │ │

Pure python reader

│ │ │ │
In [23]: f = gsd.pygsd.GSDFile(open('example.gsd', 'rb'))
│ │ │ │  
│ │ │ │  In [24]: trajectory = gsd.hoomd.HOOMDTrajectory(f);
│ │ │ │  
│ │ │ │  In [25]: trajectory[3].particles.position
│ │ │ │  Out[25]: 
│ │ │ │ -array([[0.89297575, 0.60751784, 0.39828512],
│ │ │ │ -       [0.3539692 , 0.84396565, 0.86274457],
│ │ │ │ -       [0.25198603, 0.83817095, 0.79711986],
│ │ │ │ -       [0.14295614, 0.7289324 , 0.81089723],
│ │ │ │ -       [0.9579095 , 0.04793588, 0.95506656],
│ │ │ │ -       [0.22937089, 0.3427639 , 0.7957847 ],
│ │ │ │ -       [0.48885173, 0.83030915, 0.34693772]], dtype=float32)
│ │ │ │ +array([[0.86071503, 0.8684962 , 0.8524982 ],
│ │ │ │ +       [0.00260618, 0.7631574 , 0.2306025 ],
│ │ │ │ +       [0.63282514, 0.05476646, 0.2705843 ],
│ │ │ │ +       [0.08640291, 0.2560719 , 0.90849054],
│ │ │ │ +       [0.8191478 , 0.10490891, 0.5575511 ],
│ │ │ │ +       [0.16042605, 0.30859837, 0.19020057],
│ │ │ │ +       [0.01083884, 0.48338255, 0.35933688]], dtype=float32)
│ │ │ │  
│ │ │ │
│ │ │ │

You can use GSD without needing to compile C code to read GSD files │ │ │ │ using gsd.pygsd.GSDFile in combination with gsd.hoomd.HOOMDTrajectory. It │ │ │ │ only supports the rb mode and does not read files as fast as the C │ │ │ │ implementation. It takes in a python file-like object, so it can be used with │ │ │ │ in-memory IO classes, and grid file classes that access data over the internet.

│ │ │ │ ├── html2text {} │ │ │ │ │ @@ -95,23 +95,23 @@ │ │ │ │ │ Out[16]: 5 │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ In [17]: frame.particles.N │ │ │ │ │ Out[17]: 9 │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ In [18]: frame.particles.position │ │ │ │ │ Out[18]: │ │ │ │ │ -array([[0.98634994, 0.2609803 , 0.7573276 ], │ │ │ │ │ - [0.72124755, 0.17434151, 0.9312099 ], │ │ │ │ │ - [0.30205306, 0.8568594 , 0.27031362], │ │ │ │ │ - [0.24807246, 0.33414975, 0.694913 ], │ │ │ │ │ - [0.9600695 , 0.4758474 , 0.3320576 ], │ │ │ │ │ - [0.961259 , 0.9022375 , 0.9067115 ], │ │ │ │ │ - [0.11638785, 0.48132548, 0.31074518], │ │ │ │ │ - [0.36147836, 0.5054218 , 0.5500284 ], │ │ │ │ │ - [0.43136147, 0.0093628 , 0.35895073]], dtype=float32) │ │ │ │ │ +array([[0.7728585 , 0.6417677 , 0.6185172 ], │ │ │ │ │ + [0.31226304, 0.42622846, 0.12717864], │ │ │ │ │ + [0.6962113 , 0.891335 , 0.2346277 ], │ │ │ │ │ + [0.74645686, 0.43528122, 0.8094549 ], │ │ │ │ │ + [0.39409447, 0.30772775, 0.88995653], │ │ │ │ │ + [0.02269289, 0.47618988, 0.20087525], │ │ │ │ │ + [0.7403571 , 0.57417494, 0.5038097 ], │ │ │ │ │ + [0.24330384, 0.72416556, 0.59850305], │ │ │ │ │ + [0.43724802, 0.15415701, 0.8006849 ]], dtype=float32) │ │ │ │ │ _g_s_d_._h_o_o_m_d_._H_O_O_M_D_T_r_a_j_e_c_t_o_r_y supports random indexing of frames in the file. │ │ │ │ │ Indexing into a trajectory returns a _g_s_d_._h_o_o_m_d_._F_r_a_m_e. │ │ │ │ │ ********** SSlliicciinngg aanndd sseelleeccttiioonn_?¶ ********** │ │ │ │ │ Use the slicing operator to select individual frames or a subset of a │ │ │ │ │ trajectory. │ │ │ │ │ In [19]: f = gsd.hoomd.open(name='example.gsd', mode='r') │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ @@ -130,21 +130,21 @@ │ │ │ │ │ ********** PPuurree ppyytthhoonn rreeaaddeerr_?¶ ********** │ │ │ │ │ In [23]: f = gsd.pygsd.GSDFile(open('example.gsd', 'rb')) │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ In [24]: trajectory = gsd.hoomd.HOOMDTrajectory(f); │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ In [25]: trajectory[3].particles.position │ │ │ │ │ Out[25]: │ │ │ │ │ -array([[0.89297575, 0.60751784, 0.39828512], │ │ │ │ │ - [0.3539692 , 0.84396565, 0.86274457], │ │ │ │ │ - [0.25198603, 0.83817095, 0.79711986], │ │ │ │ │ - [0.14295614, 0.7289324 , 0.81089723], │ │ │ │ │ - [0.9579095 , 0.04793588, 0.95506656], │ │ │ │ │ - [0.22937089, 0.3427639 , 0.7957847 ], │ │ │ │ │ - [0.48885173, 0.83030915, 0.34693772]], dtype=float32) │ │ │ │ │ +array([[0.86071503, 0.8684962 , 0.8524982 ], │ │ │ │ │ + [0.00260618, 0.7631574 , 0.2306025 ], │ │ │ │ │ + [0.63282514, 0.05476646, 0.2705843 ], │ │ │ │ │ + [0.08640291, 0.2560719 , 0.90849054], │ │ │ │ │ + [0.8191478 , 0.10490891, 0.5575511 ], │ │ │ │ │ + [0.16042605, 0.30859837, 0.19020057], │ │ │ │ │ + [0.01083884, 0.48338255, 0.35933688]], dtype=float32) │ │ │ │ │ You can use GGSSDD without needing to compile C code to read GGSSDD files using │ │ │ │ │ _g_s_d_._p_y_g_s_d_._G_S_D_F_i_l_e in combination with _g_s_d_._h_o_o_m_d_._H_O_O_M_D_T_r_a_j_e_c_t_o_r_y. It only │ │ │ │ │ supports the rb mode and does not read files as fast as the C implementation. │ │ │ │ │ It takes in a python file-like object, so it can be used with in-memory IO │ │ │ │ │ classes, and grid file classes that access data over the internet. │ │ │ │ │ Warning │ │ │ │ │ _g_s_d_._p_y_g_s_d is ssllooww. Use _g_s_d_._h_o_o_m_d_._o_p_e_n whenever possible. │ │ │ ├── ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/searchindex.js │ │ │ │ ├── js-beautify {} │ │ │ │ │ @@ -1870,189 +1870,189 @@ │ │ │ │ │ "12": "py:property", │ │ │ │ │ "13": "std:chunk", │ │ │ │ │ "14": "std:cmdoption" │ │ │ │ │ }, │ │ │ │ │ "terms": { │ │ │ │ │ "": [1, 2, 3, 7, 8, 11, 13, 14, 18, 21], │ │ │ │ │ "0": [0, 6, 7, 8, 11, 14, 15, 16, 18, 19], │ │ │ │ │ - "0093628": 8, │ │ │ │ │ - "04793588": 8, │ │ │ │ │ + "00260618": 8, │ │ │ │ │ + "01083884": 8, │ │ │ │ │ + "02269289": 8, │ │ │ │ │ + "05476646": 8, │ │ │ │ │ + "08640291": 8, │ │ │ │ │ "0x65df65df65df65df": 6, │ │ │ │ │ "0xaaaabbbb": 6, │ │ │ │ │ "1": [0, 6, 7, 8, 11, 12, 14, 15, 16, 18, 19], │ │ │ │ │ "10": [7, 8, 11, 14, 15], │ │ │ │ │ "100": [8, 15, 21], │ │ │ │ │ "103": 7, │ │ │ │ │ "104": 7, │ │ │ │ │ + "10490891": 8, │ │ │ │ │ "105": 7, │ │ │ │ │ "11": [7, 8, 14, 21], │ │ │ │ │ "110": 7, │ │ │ │ │ "114": 7, │ │ │ │ │ "115": 7, │ │ │ │ │ "116": 7, │ │ │ │ │ - "11638785": 8, │ │ │ │ │ "12": [7, 8, 14], │ │ │ │ │ "127": 1, │ │ │ │ │ + "12717864": 8, │ │ │ │ │ "12_gsd": [7, 8, 14], │ │ │ │ │ "13": [7, 8, 14], │ │ │ │ │ "14": [7, 8, 11, 14], │ │ │ │ │ - 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