--- /srv/reproducible-results/rbuild-debian/r-b-build.Wv4y1wp2/b1/python-gsd_3.3.0-1_i386.changes
+++ /srv/reproducible-results/rbuild-debian/r-b-build.Wv4y1wp2/b2/python-gsd_3.3.0-1_i386.changes
├── Files
│ @@ -1,4 +1,4 @@
│
│ - a80694b1de85a6167edcf55c2931d8af 130364 doc optional python-gsd-doc_3.3.0-1_all.deb
│ + 6c3b99713c68fff6d0e0d2431c030892 130408 doc optional python-gsd-doc_3.3.0-1_all.deb
│ cb9b171d783c9b463f5bf5dc4bd7f966 337344 debug optional python3-gsd-dbgsym_3.3.0-1_i386.deb
│ 0115cc609a90ddfba8bfb519a6394ed1 203872 python optional python3-gsd_3.3.0-1_i386.deb
├── python-gsd-doc_3.3.0-1_all.deb
│ ├── file list
│ │ @@ -1,3 +1,3 @@
│ │ -rw-r--r-- 0 0 0 4 2024-07-05 16:19:20.000000 debian-binary
│ │ -rw-r--r-- 0 0 0 2692 2024-07-05 16:19:20.000000 control.tar.xz
│ │ --rw-r--r-- 0 0 0 127480 2024-07-05 16:19:20.000000 data.tar.xz
│ │ +-rw-r--r-- 0 0 0 127524 2024-07-05 16:19:20.000000 data.tar.xz
│ ├── control.tar.xz
│ │ ├── control.tar
│ │ │ ├── ./md5sums
│ │ │ │ ├── ./md5sums
│ │ │ │ │┄ Files differ
│ ├── data.tar.xz
│ │ ├── data.tar
│ │ │ ├── file list
│ │ │ │ @@ -71,15 +71,15 @@
│ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 23394 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/python-api.html
│ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 87526 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/python-module-gsd.fl.html
│ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 95472 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/python-module-gsd.hoomd.html
│ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 49307 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/python-module-gsd.pygsd.html
│ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 18756 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/python-module-gsd.version.html
│ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 107555 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/schema-hoomd.html
│ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 16660 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/search.html
│ │ │ │ --rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 82718 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/searchindex.js
│ │ │ │ +-rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 82713 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/searchindex.js
│ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 32666 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/shapes.html
│ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 20804 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/specification.html
│ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 24988 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/style.html
│ │ │ │ drwxr-xr-x 0 root (0) root (0) 0 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc-base/
│ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 331 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc-base/python-gsd-doc.python-gsd
│ │ │ │ lrwxrwxrwx 0 root (0) root (0) 0 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/_static/doctools.js -> ../../../../javascript/sphinxdoc/1.0/doctools.js
│ │ │ │ lrwxrwxrwx 0 root (0) root (0) 0 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/_static/language_data.js -> ../../../../javascript/sphinxdoc/1.0/language_data.js
│ │ │ ├── ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/hoomd-examples.html
│ │ │ │ @@ -355,23 +355,23 @@
│ │ │ │ Out[16]: 5
│ │ │ │
│ │ │ │ In [17]: frame.particles.N
│ │ │ │ Out[17]: 9
│ │ │ │
│ │ │ │ In [18]: frame.particles.position
│ │ │ │ Out[18]:
│ │ │ │ -array([[0.05981082, 0.7575211 , 0.8996613 ],
│ │ │ │ - [0.07746648, 0.6652994 , 0.15677498],
│ │ │ │ - [0.65171665, 0.28931946, 0.45692492],
│ │ │ │ - [0.44059104, 0.7351273 , 0.5842594 ],
│ │ │ │ - [0.8182537 , 0.8950511 , 0.11095893],
│ │ │ │ - [0.36218163, 0.3636897 , 0.26510933],
│ │ │ │ - [0.67741734, 0.16916554, 0.56929225],
│ │ │ │ - [0.75252783, 0.9171588 , 0.77116627],
│ │ │ │ - [0.883952 , 0.13652875, 0.29556966]], dtype=float32)
│ │ │ │ +array([[0.48634815, 0.6867258 , 0.03528157],
│ │ │ │ + [0.8433599 , 0.11727525, 0.16769749],
│ │ │ │ + [0.34965527, 0.7307307 , 0.34735265],
│ │ │ │ + [0.9562315 , 0.5212931 , 0.0737936 ],
│ │ │ │ + [0.64549506, 0.17985745, 0.5454252 ],
│ │ │ │ + [0.31284085, 0.486985 , 0.02699114],
│ │ │ │ + [0.9438944 , 0.66535217, 0.9024754 ],
│ │ │ │ + [0.29612 , 0.66214716, 0.93599504],
│ │ │ │ + [0.78994656, 0.40858516, 0.5601971 ]], dtype=float32)
│ │ │ │
│ │ │ │
│ │ │ │
gsd.hoomd.HOOMDTrajectory
supports random indexing of frames in the file.
│ │ │ │ Indexing into a trajectory returns a gsd.hoomd.Frame
.
│ │ │ │
│ │ │ │
│ │ │ │ Slicing and selection
│ │ │ │ @@ -398,21 +398,21 @@
│ │ │ │ Pure python reader
│ │ │ │ In [23]: f = gsd.pygsd.GSDFile(open('example.gsd', 'rb'))
│ │ │ │
│ │ │ │ In [24]: trajectory = gsd.hoomd.HOOMDTrajectory(f);
│ │ │ │
│ │ │ │ In [25]: trajectory[3].particles.position
│ │ │ │ Out[25]:
│ │ │ │ -array([[0.7247028 , 0.9965811 , 0.5419492 ],
│ │ │ │ - [0.7102028 , 0.7927234 , 0.6280584 ],
│ │ │ │ - [0.21301605, 0.15680988, 0.24903356],
│ │ │ │ - [0.35631683, 0.3768493 , 0.5487574 ],
│ │ │ │ - [0.9130308 , 0.85825425, 0.00520051],
│ │ │ │ - [0.15103403, 0.12151265, 0.9714146 ],
│ │ │ │ - [0.09034529, 0.70830756, 0.87387866]], dtype=float32)
│ │ │ │ +array([[0.6245228 , 0.8699198 , 0.6341151 ],
│ │ │ │ + [0.11278213, 0.25649926, 0.45813057],
│ │ │ │ + [0.5320489 , 0.27361184, 0.25230864],
│ │ │ │ + [0.11753571, 0.1586123 , 0.6468357 ],
│ │ │ │ + [0.83386606, 0.94923717, 0.59539974],
│ │ │ │ + [0.8738771 , 0.6592406 , 0.22454762],
│ │ │ │ + [0.51634336, 0.79732 , 0.82060647]], dtype=float32)
│ │ │ │
│ │ │ │
│ │ │ │ You can use GSD without needing to compile C code to read GSD files
│ │ │ │ using gsd.pygsd.GSDFile
in combination with gsd.hoomd.HOOMDTrajectory
. It
│ │ │ │ only supports the rb
mode and does not read files as fast as the C
│ │ │ │ implementation. It takes in a python file-like object, so it can be used with
│ │ │ │ in-memory IO classes, and grid file classes that access data over the internet.
│ │ │ │ ├── html2text {}
│ │ │ │ │ @@ -95,23 +95,23 @@
│ │ │ │ │ Out[16]: 5
│ │ │ │ │
│ │ │ │ │ In [17]: frame.particles.N
│ │ │ │ │ Out[17]: 9
│ │ │ │ │
│ │ │ │ │ In [18]: frame.particles.position
│ │ │ │ │ Out[18]:
│ │ │ │ │ -array([[0.05981082, 0.7575211 , 0.8996613 ],
│ │ │ │ │ - [0.07746648, 0.6652994 , 0.15677498],
│ │ │ │ │ - [0.65171665, 0.28931946, 0.45692492],
│ │ │ │ │ - [0.44059104, 0.7351273 , 0.5842594 ],
│ │ │ │ │ - [0.8182537 , 0.8950511 , 0.11095893],
│ │ │ │ │ - [0.36218163, 0.3636897 , 0.26510933],
│ │ │ │ │ - [0.67741734, 0.16916554, 0.56929225],
│ │ │ │ │ - [0.75252783, 0.9171588 , 0.77116627],
│ │ │ │ │ - [0.883952 , 0.13652875, 0.29556966]], dtype=float32)
│ │ │ │ │ +array([[0.48634815, 0.6867258 , 0.03528157],
│ │ │ │ │ + [0.8433599 , 0.11727525, 0.16769749],
│ │ │ │ │ + [0.34965527, 0.7307307 , 0.34735265],
│ │ │ │ │ + [0.9562315 , 0.5212931 , 0.0737936 ],
│ │ │ │ │ + [0.64549506, 0.17985745, 0.5454252 ],
│ │ │ │ │ + [0.31284085, 0.486985 , 0.02699114],
│ │ │ │ │ + [0.9438944 , 0.66535217, 0.9024754 ],
│ │ │ │ │ + [0.29612 , 0.66214716, 0.93599504],
│ │ │ │ │ + [0.78994656, 0.40858516, 0.5601971 ]], dtype=float32)
│ │ │ │ │ _g_s_d_._h_o_o_m_d_._H_O_O_M_D_T_r_a_j_e_c_t_o_r_y supports random indexing of frames in the file.
│ │ │ │ │ Indexing into a trajectory returns a _g_s_d_._h_o_o_m_d_._F_r_a_m_e.
│ │ │ │ │ ********** SSlliicciinngg aanndd sseelleeccttiioonn_?¶ **********
│ │ │ │ │ Use the slicing operator to select individual frames or a subset of a
│ │ │ │ │ trajectory.
│ │ │ │ │ In [19]: f = gsd.hoomd.open(name='example.gsd', mode='r')
│ │ │ │ │
│ │ │ │ │ @@ -130,21 +130,21 @@
│ │ │ │ │ ********** PPuurree ppyytthhoonn rreeaaddeerr_?¶ **********
│ │ │ │ │ In [23]: f = gsd.pygsd.GSDFile(open('example.gsd', 'rb'))
│ │ │ │ │
│ │ │ │ │ In [24]: trajectory = gsd.hoomd.HOOMDTrajectory(f);
│ │ │ │ │
│ │ │ │ │ In [25]: trajectory[3].particles.position
│ │ │ │ │ Out[25]:
│ │ │ │ │ -array([[0.7247028 , 0.9965811 , 0.5419492 ],
│ │ │ │ │ - [0.7102028 , 0.7927234 , 0.6280584 ],
│ │ │ │ │ - [0.21301605, 0.15680988, 0.24903356],
│ │ │ │ │ - [0.35631683, 0.3768493 , 0.5487574 ],
│ │ │ │ │ - [0.9130308 , 0.85825425, 0.00520051],
│ │ │ │ │ - [0.15103403, 0.12151265, 0.9714146 ],
│ │ │ │ │ - [0.09034529, 0.70830756, 0.87387866]], dtype=float32)
│ │ │ │ │ +array([[0.6245228 , 0.8699198 , 0.6341151 ],
│ │ │ │ │ + [0.11278213, 0.25649926, 0.45813057],
│ │ │ │ │ + [0.5320489 , 0.27361184, 0.25230864],
│ │ │ │ │ + [0.11753571, 0.1586123 , 0.6468357 ],
│ │ │ │ │ + [0.83386606, 0.94923717, 0.59539974],
│ │ │ │ │ + [0.8738771 , 0.6592406 , 0.22454762],
│ │ │ │ │ + [0.51634336, 0.79732 , 0.82060647]], dtype=float32)
│ │ │ │ │ You can use GGSSDD without needing to compile C code to read GGSSDD files using
│ │ │ │ │ _g_s_d_._p_y_g_s_d_._G_S_D_F_i_l_e in combination with _g_s_d_._h_o_o_m_d_._H_O_O_M_D_T_r_a_j_e_c_t_o_r_y. It only
│ │ │ │ │ supports the rb mode and does not read files as fast as the C implementation.
│ │ │ │ │ It takes in a python file-like object, so it can be used with in-memory IO
│ │ │ │ │ classes, and grid file classes that access data over the internet.
│ │ │ │ │ Warning
│ │ │ │ │ _g_s_d_._p_y_g_s_d is ssllooww. Use _g_s_d_._h_o_o_m_d_._o_p_e_n whenever possible.
│ │ │ ├── ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/searchindex.js
│ │ │ │ ├── js-beautify {}
│ │ │ │ │ @@ -1870,189 +1870,189 @@
│ │ │ │ │ "12": "py:property",
│ │ │ │ │ "13": "std:chunk",
│ │ │ │ │ "14": "std:cmdoption"
│ │ │ │ │ },
│ │ │ │ │ "terms": {
│ │ │ │ │ "": [1, 2, 3, 7, 8, 11, 13, 14, 18, 21],
│ │ │ │ │ "0": [0, 6, 7, 8, 11, 14, 15, 16, 18, 19],
│ │ │ │ │ - "00520051": 8,
│ │ │ │ │ - "05981082": 8,
│ │ │ │ │ - "07746648": 8,
│ │ │ │ │ - "09034529": 8,
│ │ │ │ │ + "02699114": 8,
│ │ │ │ │ + "03528157": 8,
│ │ │ │ │ + "0737936": 8,
│ │ │ │ │ "0x65df65df65df65df": 6,
│ │ │ │ │ "0xaaaabbbb": 6,
│ │ │ │ │ "1": [0, 6, 7, 8, 11, 12, 14, 15, 16, 18, 19],
│ │ │ │ │ "10": [7, 8, 11, 14, 15],
│ │ │ │ │ "100": [8, 15, 21],
│ │ │ │ │ "103": 7,
│ │ │ │ │ "104": 7,
│ │ │ │ │ "105": 7,
│ │ │ │ │ "11": [7, 8, 14, 21],
│ │ │ │ │ "110": 7,
│ │ │ │ │ - "11095893": 8,
│ │ │ │ │ + "11278213": 8,
│ │ │ │ │ "114": 7,
│ │ │ │ │ "115": 7,
│ │ │ │ │ "116": 7,
│ │ │ │ │ + "11727525": 8,
│ │ │ │ │ + "11753571": 8,
│ │ │ │ │ "12": [7, 8, 14],
│ │ │ │ │ - "12151265": 8,
│ │ │ │ │ "127": 1,
│ │ │ │ │ "12_gsd": [7, 8, 14],
│ │ │ │ │ "13": [7, 8, 14],
│ │ │ │ │ - "13652875": 8,
│ │ │ │ │ "14": [7, 8, 11, 14],
│ │ │ │ │ "15": [7, 8, 14],
│ │ │ │ │ - "15103403": 8,
│ │ │ │ │ - "15677498": 8,
│ │ │ │ │ - "15680988": 8,
│ │ │ │ │ + "1586123": 8,
│ │ │ │ │ "16": [0, 6, 7, 8, 14],
│ │ │ │ │ - "16916554": 8,
│ │ │ │ │ + "16769749": 8,
│ │ │ │ │ "17": [7, 8, 14],
│ │ │ │ │ + "17985745": 8,
│ │ │ │ │ "18": [7, 8, 11],
│ │ │ │ │ "19": [7, 8, 11, 14],
│ │ │ │ │ "1d": [14, 16],
│ │ │ │ │ "1x1": [18, 19],
│ │ │ │ │ "2": [0, 6, 7, 8, 12, 14, 15, 16, 18, 19],
│ │ │ │ │ "20": [7, 8],
│ │ │ │ │ "200": [8, 15],
│ │ │ │ │ "2016": 12,
│ │ │ │ │ "2019": 11,
│ │ │ │ │ "2022": 11,
│ │ │ │ │ "2024": 12,
│ │ │ │ │ "21": [7, 8],
│ │ │ │ │ - "21301605": 8,
│ │ │ │ │ "22": [7, 8, 11],
│ │ │ │ │ + "22454762": 8,
│ │ │ │ │ "23": [7, 8],
│ │ │ │ │ "235": 1,
│ │ │ │ │ "237": 1,
│ │ │ │ │ "238": 1,
│ │ │ │ │ "24": [7, 8],
│ │ │ │ │ "249": 1,
│ │ │ │ │ - "24903356": 8,
│ │ │ │ │ "25": [7, 8],
│ │ │ │ │ + "25230864": 8,
│ │ │ │ │ "255": 1,
│ │ │ │ │ "256": [0, 6],
│ │ │ │ │ + "25649926": 8,
│ │ │ │ │ "257": 1,
│ │ │ │ │ "26": [7, 8],
│ │ │ │ │ - "26510933": 8,
│ │ │ │ │ "266": 1,
│ │ │ │ │ "267": 1,
│ │ │ │ │ "27": [7, 8],
│ │ │ │ │ "270": 1,
│ │ │ │ │ + "27361184": 8,
│ │ │ │ │ "28": [7, 8],
│ │ │ │ │ "283": 1,
│ │ │ │ │ - "28931946": 8,
│ │ │ │ │ "29": [7, 8],
│ │ │ │ │ - "29556966": 8,
│ │ │ │ │ + "29612": 8,
│ │ │ │ │ "2d": [14, 16, 18, 19],
│ │ │ │ │ "2gib": 1,
│ │ │ │ │ "3": [7, 8, 11, 14, 15, 16, 18, 19],
│ │ │ │ │ "30": [7, 8],
│ │ │ │ │ "300": [8, 15],
│ │ │ │ │ "308": 1,
│ │ │ │ │ "31": [7, 8],
│ │ │ │ │ + "31284085": 8,
│ │ │ │ │ "317": 1,
│ │ │ │ │ "319": 1,
│ │ │ │ │ "32": [0, 6, 7, 18],
│ │ │ │ │ "322": 1,
│ │ │ │ │ "323": 1,
│ │ │ │ │ "324": 1,
│ │ │ │ │ "325": 1,
│ │ │ │ │ "33": 7,
│ │ │ │ │ "34": 7,
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