--- /srv/reproducible-results/rbuild-debian/r-b-build.Wv4y1wp2/b1/python-gsd_3.3.0-1_i386.changes +++ /srv/reproducible-results/rbuild-debian/r-b-build.Wv4y1wp2/b2/python-gsd_3.3.0-1_i386.changes ├── Files │ @@ -1,4 +1,4 @@ │ │ - a80694b1de85a6167edcf55c2931d8af 130364 doc optional python-gsd-doc_3.3.0-1_all.deb │ + 6c3b99713c68fff6d0e0d2431c030892 130408 doc optional python-gsd-doc_3.3.0-1_all.deb │ cb9b171d783c9b463f5bf5dc4bd7f966 337344 debug optional python3-gsd-dbgsym_3.3.0-1_i386.deb │ 0115cc609a90ddfba8bfb519a6394ed1 203872 python optional python3-gsd_3.3.0-1_i386.deb ├── python-gsd-doc_3.3.0-1_all.deb │ ├── file list │ │ @@ -1,3 +1,3 @@ │ │ -rw-r--r-- 0 0 0 4 2024-07-05 16:19:20.000000 debian-binary │ │ -rw-r--r-- 0 0 0 2692 2024-07-05 16:19:20.000000 control.tar.xz │ │ --rw-r--r-- 0 0 0 127480 2024-07-05 16:19:20.000000 data.tar.xz │ │ +-rw-r--r-- 0 0 0 127524 2024-07-05 16:19:20.000000 data.tar.xz │ ├── control.tar.xz │ │ ├── control.tar │ │ │ ├── ./md5sums │ │ │ │ ├── ./md5sums │ │ │ │ │┄ Files differ │ ├── data.tar.xz │ │ ├── data.tar │ │ │ ├── file list │ │ │ │ @@ -71,15 +71,15 @@ │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 23394 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/python-api.html │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 87526 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/python-module-gsd.fl.html │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 95472 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/python-module-gsd.hoomd.html │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 49307 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/python-module-gsd.pygsd.html │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 18756 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/python-module-gsd.version.html │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 107555 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/schema-hoomd.html │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 16660 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/search.html │ │ │ │ --rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 82718 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/searchindex.js │ │ │ │ +-rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 82713 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/searchindex.js │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 32666 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/shapes.html │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 20804 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/specification.html │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 24988 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/style.html │ │ │ │ drwxr-xr-x 0 root (0) root (0) 0 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc-base/ │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 331 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc-base/python-gsd-doc.python-gsd │ │ │ │ lrwxrwxrwx 0 root (0) root (0) 0 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/_static/doctools.js -> ../../../../javascript/sphinxdoc/1.0/doctools.js │ │ │ │ lrwxrwxrwx 0 root (0) root (0) 0 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/_static/language_data.js -> ../../../../javascript/sphinxdoc/1.0/language_data.js │ │ │ ├── ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/hoomd-examples.html │ │ │ │ @@ -355,23 +355,23 @@ │ │ │ │ Out[16]: 5 │ │ │ │ │ │ │ │ In [17]: frame.particles.N │ │ │ │ Out[17]: 9 │ │ │ │ │ │ │ │ In [18]: frame.particles.position │ │ │ │ Out[18]: │ │ │ │ -array([[0.05981082, 0.7575211 , 0.8996613 ], │ │ │ │ - [0.07746648, 0.6652994 , 0.15677498], │ │ │ │ - [0.65171665, 0.28931946, 0.45692492], │ │ │ │ - [0.44059104, 0.7351273 , 0.5842594 ], │ │ │ │ - [0.8182537 , 0.8950511 , 0.11095893], │ │ │ │ - [0.36218163, 0.3636897 , 0.26510933], │ │ │ │ - [0.67741734, 0.16916554, 0.56929225], │ │ │ │ - [0.75252783, 0.9171588 , 0.77116627], │ │ │ │ - [0.883952 , 0.13652875, 0.29556966]], dtype=float32) │ │ │ │ +array([[0.48634815, 0.6867258 , 0.03528157], │ │ │ │ + [0.8433599 , 0.11727525, 0.16769749], │ │ │ │ + [0.34965527, 0.7307307 , 0.34735265], │ │ │ │ + [0.9562315 , 0.5212931 , 0.0737936 ], │ │ │ │ + [0.64549506, 0.17985745, 0.5454252 ], │ │ │ │ + [0.31284085, 0.486985 , 0.02699114], │ │ │ │ + [0.9438944 , 0.66535217, 0.9024754 ], │ │ │ │ + [0.29612 , 0.66214716, 0.93599504], │ │ │ │ + [0.78994656, 0.40858516, 0.5601971 ]], dtype=float32) │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ │

gsd.hoomd.HOOMDTrajectory supports random indexing of frames in the file. │ │ │ │ Indexing into a trajectory returns a gsd.hoomd.Frame.

│ │ │ │ │ │ │ │
│ │ │ │

Slicing and selection

│ │ │ │ @@ -398,21 +398,21 @@ │ │ │ │

Pure python reader

│ │ │ │
In [23]: f = gsd.pygsd.GSDFile(open('example.gsd', 'rb'))
│ │ │ │  
│ │ │ │  In [24]: trajectory = gsd.hoomd.HOOMDTrajectory(f);
│ │ │ │  
│ │ │ │  In [25]: trajectory[3].particles.position
│ │ │ │  Out[25]: 
│ │ │ │ -array([[0.7247028 , 0.9965811 , 0.5419492 ],
│ │ │ │ -       [0.7102028 , 0.7927234 , 0.6280584 ],
│ │ │ │ -       [0.21301605, 0.15680988, 0.24903356],
│ │ │ │ -       [0.35631683, 0.3768493 , 0.5487574 ],
│ │ │ │ -       [0.9130308 , 0.85825425, 0.00520051],
│ │ │ │ -       [0.15103403, 0.12151265, 0.9714146 ],
│ │ │ │ -       [0.09034529, 0.70830756, 0.87387866]], dtype=float32)
│ │ │ │ +array([[0.6245228 , 0.8699198 , 0.6341151 ],
│ │ │ │ +       [0.11278213, 0.25649926, 0.45813057],
│ │ │ │ +       [0.5320489 , 0.27361184, 0.25230864],
│ │ │ │ +       [0.11753571, 0.1586123 , 0.6468357 ],
│ │ │ │ +       [0.83386606, 0.94923717, 0.59539974],
│ │ │ │ +       [0.8738771 , 0.6592406 , 0.22454762],
│ │ │ │ +       [0.51634336, 0.79732   , 0.82060647]], dtype=float32)
│ │ │ │  
│ │ │ │
│ │ │ │

You can use GSD without needing to compile C code to read GSD files │ │ │ │ using gsd.pygsd.GSDFile in combination with gsd.hoomd.HOOMDTrajectory. It │ │ │ │ only supports the rb mode and does not read files as fast as the C │ │ │ │ implementation. It takes in a python file-like object, so it can be used with │ │ │ │ in-memory IO classes, and grid file classes that access data over the internet.

│ │ │ │ ├── html2text {} │ │ │ │ │ @@ -95,23 +95,23 @@ │ │ │ │ │ Out[16]: 5 │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ In [17]: frame.particles.N │ │ │ │ │ Out[17]: 9 │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ In [18]: frame.particles.position │ │ │ │ │ Out[18]: │ │ │ │ │ -array([[0.05981082, 0.7575211 , 0.8996613 ], │ │ │ │ │ - [0.07746648, 0.6652994 , 0.15677498], │ │ │ │ │ - [0.65171665, 0.28931946, 0.45692492], │ │ │ │ │ - [0.44059104, 0.7351273 , 0.5842594 ], │ │ │ │ │ - [0.8182537 , 0.8950511 , 0.11095893], │ │ │ │ │ - [0.36218163, 0.3636897 , 0.26510933], │ │ │ │ │ - [0.67741734, 0.16916554, 0.56929225], │ │ │ │ │ - [0.75252783, 0.9171588 , 0.77116627], │ │ │ │ │ - [0.883952 , 0.13652875, 0.29556966]], dtype=float32) │ │ │ │ │ +array([[0.48634815, 0.6867258 , 0.03528157], │ │ │ │ │ + [0.8433599 , 0.11727525, 0.16769749], │ │ │ │ │ + [0.34965527, 0.7307307 , 0.34735265], │ │ │ │ │ + [0.9562315 , 0.5212931 , 0.0737936 ], │ │ │ │ │ + [0.64549506, 0.17985745, 0.5454252 ], │ │ │ │ │ + [0.31284085, 0.486985 , 0.02699114], │ │ │ │ │ + [0.9438944 , 0.66535217, 0.9024754 ], │ │ │ │ │ + [0.29612 , 0.66214716, 0.93599504], │ │ │ │ │ + [0.78994656, 0.40858516, 0.5601971 ]], dtype=float32) │ │ │ │ │ _g_s_d_._h_o_o_m_d_._H_O_O_M_D_T_r_a_j_e_c_t_o_r_y supports random indexing of frames in the file. │ │ │ │ │ Indexing into a trajectory returns a _g_s_d_._h_o_o_m_d_._F_r_a_m_e. │ │ │ │ │ ********** SSlliicciinngg aanndd sseelleeccttiioonn_?¶ ********** │ │ │ │ │ Use the slicing operator to select individual frames or a subset of a │ │ │ │ │ trajectory. │ │ │ │ │ In [19]: f = gsd.hoomd.open(name='example.gsd', mode='r') │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ @@ -130,21 +130,21 @@ │ │ │ │ │ ********** PPuurree ppyytthhoonn rreeaaddeerr_?¶ ********** │ │ │ │ │ In [23]: f = gsd.pygsd.GSDFile(open('example.gsd', 'rb')) │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ In [24]: trajectory = gsd.hoomd.HOOMDTrajectory(f); │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ In [25]: trajectory[3].particles.position │ │ │ │ │ Out[25]: │ │ │ │ │ -array([[0.7247028 , 0.9965811 , 0.5419492 ], │ │ │ │ │ - [0.7102028 , 0.7927234 , 0.6280584 ], │ │ │ │ │ - [0.21301605, 0.15680988, 0.24903356], │ │ │ │ │ - [0.35631683, 0.3768493 , 0.5487574 ], │ │ │ │ │ - [0.9130308 , 0.85825425, 0.00520051], │ │ │ │ │ - [0.15103403, 0.12151265, 0.9714146 ], │ │ │ │ │ - [0.09034529, 0.70830756, 0.87387866]], dtype=float32) │ │ │ │ │ +array([[0.6245228 , 0.8699198 , 0.6341151 ], │ │ │ │ │ + [0.11278213, 0.25649926, 0.45813057], │ │ │ │ │ + [0.5320489 , 0.27361184, 0.25230864], │ │ │ │ │ + [0.11753571, 0.1586123 , 0.6468357 ], │ │ │ │ │ + [0.83386606, 0.94923717, 0.59539974], │ │ │ │ │ + [0.8738771 , 0.6592406 , 0.22454762], │ │ │ │ │ + [0.51634336, 0.79732 , 0.82060647]], dtype=float32) │ │ │ │ │ You can use GGSSDD without needing to compile C code to read GGSSDD files using │ │ │ │ │ _g_s_d_._p_y_g_s_d_._G_S_D_F_i_l_e in combination with _g_s_d_._h_o_o_m_d_._H_O_O_M_D_T_r_a_j_e_c_t_o_r_y. It only │ │ │ │ │ supports the rb mode and does not read files as fast as the C implementation. │ │ │ │ │ It takes in a python file-like object, so it can be used with in-memory IO │ │ │ │ │ classes, and grid file classes that access data over the internet. │ │ │ │ │ Warning │ │ │ │ │ _g_s_d_._p_y_g_s_d is ssllooww. Use _g_s_d_._h_o_o_m_d_._o_p_e_n whenever possible. │ │ │ ├── ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/searchindex.js │ │ │ │ ├── js-beautify {} │ │ │ │ │ @@ -1870,189 +1870,189 @@ │ │ │ │ │ "12": "py:property", │ │ │ │ │ "13": "std:chunk", │ │ │ │ │ "14": "std:cmdoption" │ │ │ │ │ }, │ │ │ │ │ "terms": { │ │ │ │ │ "": [1, 2, 3, 7, 8, 11, 13, 14, 18, 21], │ │ │ │ │ "0": [0, 6, 7, 8, 11, 14, 15, 16, 18, 19], │ │ │ │ │ - "00520051": 8, │ │ │ │ │ - "05981082": 8, │ │ │ │ │ - "07746648": 8, │ │ │ │ │ - "09034529": 8, │ │ │ │ │ + "02699114": 8, │ │ │ │ │ + "03528157": 8, │ │ │ │ │ + "0737936": 8, │ │ │ │ │ "0x65df65df65df65df": 6, │ │ │ │ │ "0xaaaabbbb": 6, │ │ │ │ │ "1": [0, 6, 7, 8, 11, 12, 14, 15, 16, 18, 19], │ │ │ │ │ "10": [7, 8, 11, 14, 15], │ │ │ │ │ "100": [8, 15, 21], │ │ │ │ │ "103": 7, │ │ │ │ │ "104": 7, │ │ │ │ │ "105": 7, │ │ │ │ │ "11": [7, 8, 14, 21], │ │ │ │ │ "110": 7, │ │ │ │ │ - "11095893": 8, │ │ │ │ │ + "11278213": 8, │ │ │ │ │ "114": 7, │ │ │ │ │ "115": 7, │ │ │ │ │ "116": 7, │ │ │ │ │ + "11727525": 8, │ │ │ │ │ + "11753571": 8, │ │ │ │ │ "12": [7, 8, 14], │ │ │ │ │ - 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