--- /srv/reproducible-results/rbuild-debian/r-b-build.jeTvDxrF/b1/python-gsd_3.3.0-1_amd64.changes +++ /srv/reproducible-results/rbuild-debian/r-b-build.jeTvDxrF/b2/python-gsd_3.3.0-1_amd64.changes ├── Files │ @@ -1,4 +1,4 @@ │ │ - 9f50d896982ab50d37778d70132a76e4 130400 doc optional python-gsd-doc_3.3.0-1_all.deb │ + 09c9c194c55e2a6e82d0ed7978e925f2 130388 doc optional python-gsd-doc_3.3.0-1_all.deb │ 4354e77ce395ad181a1ee62046235972 352432 debug optional python3-gsd-dbgsym_3.3.0-1_amd64.deb │ ccd3da5d707e1b8bdebeb036fe51c258 201044 python optional python3-gsd_3.3.0-1_amd64.deb ├── python-gsd-doc_3.3.0-1_all.deb │ ├── file list │ │ @@ -1,3 +1,3 @@ │ │ -rw-r--r-- 0 0 0 4 2024-07-05 16:19:20.000000 debian-binary │ │ --rw-r--r-- 0 0 0 2696 2024-07-05 16:19:20.000000 control.tar.xz │ │ --rw-r--r-- 0 0 0 127512 2024-07-05 16:19:20.000000 data.tar.xz │ │ +-rw-r--r-- 0 0 0 2692 2024-07-05 16:19:20.000000 control.tar.xz │ │ +-rw-r--r-- 0 0 0 127504 2024-07-05 16:19:20.000000 data.tar.xz │ ├── control.tar.xz │ │ ├── control.tar │ │ │ ├── ./md5sums │ │ │ │ ├── ./md5sums │ │ │ │ │┄ Files differ │ ├── data.tar.xz │ │ ├── data.tar │ │ │ ├── file list │ │ │ │ @@ -71,15 +71,15 @@ │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 23394 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/python-api.html │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 87526 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/python-module-gsd.fl.html │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 95472 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/python-module-gsd.hoomd.html │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 49307 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/python-module-gsd.pygsd.html │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 18756 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/python-module-gsd.version.html │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 107555 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/schema-hoomd.html │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 16660 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/search.html │ │ │ │ --rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 82713 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/searchindex.js │ │ │ │ +-rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 82718 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/searchindex.js │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 32666 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/shapes.html │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 20804 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/specification.html │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 24988 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/style.html │ │ │ │ drwxr-xr-x 0 root (0) root (0) 0 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc-base/ │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 331 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc-base/python-gsd-doc.python-gsd │ │ │ │ lrwxrwxrwx 0 root (0) root (0) 0 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/_static/doctools.js -> ../../../../javascript/sphinxdoc/1.0/doctools.js │ │ │ │ lrwxrwxrwx 0 root (0) root (0) 0 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/_static/language_data.js -> ../../../../javascript/sphinxdoc/1.0/language_data.js │ │ │ ├── ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/hoomd-examples.html │ │ │ │ @@ -355,23 +355,23 @@ │ │ │ │ Out[16]: 5 │ │ │ │ │ │ │ │ In [17]: frame.particles.N │ │ │ │ Out[17]: 9 │ │ │ │ │ │ │ │ In [18]: frame.particles.position │ │ │ │ Out[18]: │ │ │ │ -array([[0.3906053 , 0.7982939 , 0.13249825], │ │ │ │ - [0.08762941, 0.9698718 , 0.7465096 ], │ │ │ │ - [0.5217746 , 0.5869636 , 0.05711472], │ │ │ │ - [0.43368328, 0.19981961, 0.99849916], │ │ │ │ - [0.26216894, 0.9755526 , 0.79254746], │ │ │ │ - [0.8000221 , 0.4555179 , 0.01714437], │ │ │ │ - [0.02250571, 0.81580526, 0.90255946], │ │ │ │ - [0.41454065, 0.795025 , 0.72614133], │ │ │ │ - [0.55761117, 0.5245034 , 0.5643201 ]], dtype=float32) │ │ │ │ +array([[0.34500182, 0.50312454, 0.16205648], │ │ │ │ + [0.41659373, 0.6363003 , 0.37928304], │ │ │ │ + [0.7680027 , 0.47234228, 0.24231546], │ │ │ │ + [0.9044785 , 0.39045572, 0.21271239], │ │ │ │ + [0.97232676, 0.48578948, 0.33545575], │ │ │ │ + [0.2845195 , 0.22092439, 0.8631076 ], │ │ │ │ + [0.85210484, 0.40112188, 0.68633413], │ │ │ │ + [0.58596283, 0.7709515 , 0.820715 ], │ │ │ │ + [0.938334 , 0.6847929 , 0.5444276 ]], dtype=float32) │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ │

gsd.hoomd.HOOMDTrajectory supports random indexing of frames in the file. │ │ │ │ Indexing into a trajectory returns a gsd.hoomd.Frame.

│ │ │ │ │ │ │ │
│ │ │ │

Slicing and selection

│ │ │ │ @@ -398,21 +398,21 @@ │ │ │ │

Pure python reader

│ │ │ │
In [23]: f = gsd.pygsd.GSDFile(open('example.gsd', 'rb'))
│ │ │ │  
│ │ │ │  In [24]: trajectory = gsd.hoomd.HOOMDTrajectory(f);
│ │ │ │  
│ │ │ │  In [25]: trajectory[3].particles.position
│ │ │ │  Out[25]: 
│ │ │ │ -array([[0.37039247, 0.30891952, 0.8251746 ],
│ │ │ │ -       [0.653635  , 0.11954182, 0.6019412 ],
│ │ │ │ -       [0.6172643 , 0.17101894, 0.46162254],
│ │ │ │ -       [0.80561113, 0.33783922, 0.978411  ],
│ │ │ │ -       [0.9547193 , 0.8199346 , 0.7679181 ],
│ │ │ │ -       [0.2933946 , 0.6690161 , 0.74442685],
│ │ │ │ -       [0.11007647, 0.8694062 , 0.19159201]], dtype=float32)
│ │ │ │ +array([[0.69176614, 0.15584548, 0.37557462],
│ │ │ │ +       [0.70840347, 0.53091973, 0.6832412 ],
│ │ │ │ +       [0.03283734, 0.4477202 , 0.9881101 ],
│ │ │ │ +       [0.21695948, 0.65363663, 0.1257673 ],
│ │ │ │ +       [0.33138326, 0.8949739 , 0.3779857 ],
│ │ │ │ +       [0.7785498 , 0.68830144, 0.39934534],
│ │ │ │ +       [0.5390124 , 0.8151408 , 0.35981557]], dtype=float32)
│ │ │ │  
│ │ │ │
│ │ │ │

You can use GSD without needing to compile C code to read GSD files │ │ │ │ using gsd.pygsd.GSDFile in combination with gsd.hoomd.HOOMDTrajectory. It │ │ │ │ only supports the rb mode and does not read files as fast as the C │ │ │ │ implementation. It takes in a python file-like object, so it can be used with │ │ │ │ in-memory IO classes, and grid file classes that access data over the internet.

│ │ │ │ ├── html2text {} │ │ │ │ │ @@ -95,23 +95,23 @@ │ │ │ │ │ Out[16]: 5 │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ In [17]: frame.particles.N │ │ │ │ │ Out[17]: 9 │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ In [18]: frame.particles.position │ │ │ │ │ Out[18]: │ │ │ │ │ -array([[0.3906053 , 0.7982939 , 0.13249825], │ │ │ │ │ - [0.08762941, 0.9698718 , 0.7465096 ], │ │ │ │ │ - [0.5217746 , 0.5869636 , 0.05711472], │ │ │ │ │ - [0.43368328, 0.19981961, 0.99849916], │ │ │ │ │ - [0.26216894, 0.9755526 , 0.79254746], │ │ │ │ │ - [0.8000221 , 0.4555179 , 0.01714437], │ │ │ │ │ - [0.02250571, 0.81580526, 0.90255946], │ │ │ │ │ - [0.41454065, 0.795025 , 0.72614133], │ │ │ │ │ - [0.55761117, 0.5245034 , 0.5643201 ]], dtype=float32) │ │ │ │ │ +array([[0.34500182, 0.50312454, 0.16205648], │ │ │ │ │ + [0.41659373, 0.6363003 , 0.37928304], │ │ │ │ │ + [0.7680027 , 0.47234228, 0.24231546], │ │ │ │ │ + [0.9044785 , 0.39045572, 0.21271239], │ │ │ │ │ + [0.97232676, 0.48578948, 0.33545575], │ │ │ │ │ + [0.2845195 , 0.22092439, 0.8631076 ], │ │ │ │ │ + [0.85210484, 0.40112188, 0.68633413], │ │ │ │ │ + [0.58596283, 0.7709515 , 0.820715 ], │ │ │ │ │ + [0.938334 , 0.6847929 , 0.5444276 ]], dtype=float32) │ │ │ │ │ _g_s_d_._h_o_o_m_d_._H_O_O_M_D_T_r_a_j_e_c_t_o_r_y supports random indexing of frames in the file. │ │ │ │ │ Indexing into a trajectory returns a _g_s_d_._h_o_o_m_d_._F_r_a_m_e. │ │ │ │ │ ********** SSlliicciinngg aanndd sseelleeccttiioonn_?¶ ********** │ │ │ │ │ Use the slicing operator to select individual frames or a subset of a │ │ │ │ │ trajectory. │ │ │ │ │ In [19]: f = gsd.hoomd.open(name='example.gsd', mode='r') │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ @@ -130,21 +130,21 @@ │ │ │ │ │ ********** PPuurree ppyytthhoonn rreeaaddeerr_?¶ ********** │ │ │ │ │ In [23]: f = gsd.pygsd.GSDFile(open('example.gsd', 'rb')) │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ In [24]: trajectory = gsd.hoomd.HOOMDTrajectory(f); │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ In [25]: trajectory[3].particles.position │ │ │ │ │ Out[25]: │ │ │ │ │ -array([[0.37039247, 0.30891952, 0.8251746 ], │ │ │ │ │ - [0.653635 , 0.11954182, 0.6019412 ], │ │ │ │ │ - [0.6172643 , 0.17101894, 0.46162254], │ │ │ │ │ - [0.80561113, 0.33783922, 0.978411 ], │ │ │ │ │ - [0.9547193 , 0.8199346 , 0.7679181 ], │ │ │ │ │ - [0.2933946 , 0.6690161 , 0.74442685], │ │ │ │ │ - [0.11007647, 0.8694062 , 0.19159201]], dtype=float32) │ │ │ │ │ +array([[0.69176614, 0.15584548, 0.37557462], │ │ │ │ │ + [0.70840347, 0.53091973, 0.6832412 ], │ │ │ │ │ + [0.03283734, 0.4477202 , 0.9881101 ], │ │ │ │ │ + [0.21695948, 0.65363663, 0.1257673 ], │ │ │ │ │ + [0.33138326, 0.8949739 , 0.3779857 ], │ │ │ │ │ + [0.7785498 , 0.68830144, 0.39934534], │ │ │ │ │ + [0.5390124 , 0.8151408 , 0.35981557]], dtype=float32) │ │ │ │ │ You can use GGSSDD without needing to compile C code to read GGSSDD files using │ │ │ │ │ _g_s_d_._p_y_g_s_d_._G_S_D_F_i_l_e in combination with _g_s_d_._h_o_o_m_d_._H_O_O_M_D_T_r_a_j_e_c_t_o_r_y. It only │ │ │ │ │ supports the rb mode and does not read files as fast as the C implementation. │ │ │ │ │ It takes in a python file-like object, so it can be used with in-memory IO │ │ │ │ │ classes, and grid file classes that access data over the internet. │ │ │ │ │ Warning │ │ │ │ │ _g_s_d_._p_y_g_s_d is ssllooww. Use _g_s_d_._h_o_o_m_d_._o_p_e_n whenever possible. │ │ │ ├── ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/searchindex.js │ │ │ │ ├── js-beautify {} │ │ │ │ │ @@ -1870,189 +1870,189 @@ │ │ │ │ │ "12": "py:property", │ │ │ │ │ "13": "std:chunk", │ │ │ │ │ "14": "std:cmdoption" │ │ │ │ │ }, │ │ │ │ │ "terms": { │ │ │ │ │ "": [1, 2, 3, 7, 8, 11, 13, 14, 18, 21], │ │ │ │ │ "0": [0, 6, 7, 8, 11, 14, 15, 16, 18, 19], │ │ │ │ │ - "01714437": 8, │ │ │ │ │ - "02250571": 8, │ │ │ │ │ - "05711472": 8, │ │ │ │ │ - "08762941": 8, │ │ │ │ │ + "03283734": 8, │ │ │ │ │ "0x65df65df65df65df": 6, │ │ │ │ │ "0xaaaabbbb": 6, │ │ │ │ │ "1": [0, 6, 7, 8, 11, 12, 14, 15, 16, 18, 19], │ │ │ │ │ "10": [7, 8, 11, 14, 15], │ │ │ │ │ "100": [8, 15, 21], │ │ │ │ │ "103": 7, │ │ │ │ │ "104": 7, │ │ │ │ │ "105": 7, │ │ │ │ │ "11": [7, 8, 14, 21], │ │ │ │ │ "110": 7, │ │ │ │ │ - "11007647": 8, │ │ │ │ │ "114": 7, │ │ │ │ │ "115": 7, │ │ │ │ │ "116": 7, │ │ │ │ │ - "11954182": 8, │ │ │ │ │ "12": [7, 8, 14], │ │ │ │ │ + "1257673": 8, │ │ │ │ │ "127": 1, │ │ │ │ │ "12_gsd": [7, 8, 14], │ │ │ │ │ "13": [7, 8, 14], │ │ │ │ │ - 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