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+0003e860: 6475 6c65 5f73 7263 5f67 726f 6d61 6373 dule_src_gromacs │ │ │ │ +0003e870: 5f61 7070 6c69 6564 5f66 6f72 6365 735f _applied_forces_ │ │ │ │ +0003e880: 6177 6826 2334 353b 2667 743b 6d6f 6475 awh->modu │ │ │ │ +0003e890: 6c65 5f73 7263 5f67 726f 6d61 6373 5f6d le_src_gromacs_m │ │ │ │ +0003e8a0: 6474 7970 6573 3c2f 7469 746c 653e 0a3c dtypes.< │ │ │ │ +0003e8b0: 7061 7468 2066 696c 6c3d 226e 6f6e 6522 path fill="none" │ │ │ │ +0003e8c0: 2073 7472 6f6b 653d 2223 6266 6266 6266 stroke="#bfbfbf │ │ │ │ +0003e8d0: 2220 643d 224d 3139 3039 2e34 352c 2d31 " d="M1909.45,-1 │ │ │ │ +0003e8e0: 3238 322e 3333 4331 3832 392c 2d31 3237 282.33C1829,-127 │ │ │ │ +0003e8f0: 302e 3133 2031 3537 352e 3436 2c2d 3132 0.13 1575.46,-12 │ │ │ │ +0003e900: 3237 2e33 3820 3133 3730 2c2d 3131 3734 27.38 1370,-1174 │ │ │ │ +0003e910: 2e35 3320 3132 3830 2e31 372c 2d31 3135 .53 1280.17,-115 │ │ │ │ +0003e920: 312e 3432 2031 3235 352e 3333 2c2d 3131 1.42 1255.33,-11 │ │ │ │ +0003e930: 3530 2e32 3920 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│ │ │ │
Module dependency graph
│ │ │ │
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│ │ │ │

The graph below shows the dependencies between the source code modules, computed from include statements in the code. For documented modules (those that do not have a gray background), clicking on the module takes you to the module documentation. Legend for the graph can be found below the graph.

│ │ │ │

│ │ │ │ -
│ │ │ │ +
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│ │ │ │ Legend

│ │ │ │

The graph below annotates the colors and line styles used in the module dependency graph above. More detailed textual annotation is below the graph.

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│ │ │ │

Node colors:

│ │ │ ├── ./usr/share/doc/gromacs/html/manual-2022.5-Debian_2022.5_2.pdf │ │ │ │ ├── pdftotext {} - │ │ │ │ │ @@ -17478,15 +17478,15 @@ │ │ │ │ │ Karkoulis, Peter Kasson, Jiri Kraus, Per Larsson, Justin A. Lemkul, Viveca Lindahl, Erik Marklund, │ │ │ │ │ Pieter Meulenhoff, Vedran Miletic, Teemu Murtola, Sander Pronk, Alexey Shvetsov, Alfons Sijbers, │ │ │ │ │ Peter Tieleman, Jon Vincent, Teemu Virolainen, Christian Wennberg, Maarten Wolf │ │ │ │ │ Project leaders: Paul Bauer, Berk Hess, Erik Lindahl │ │ │ │ │ © 1991 – 2000: │ │ │ │ │ Department of Biophysical Chemistry, University of Groningen. Nijenborgh 4, 9747 AG │ │ │ │ │ Groningen, The Netherlands. │ │ │ │ │ -© 2001 – 2025: │ │ │ │ │ +© 2001 – 2024: │ │ │ │ │ The GROMACS development teams at the Royal Institute of Technology and Uppsala │ │ │ │ │ University, Sweden. │ │ │ │ │ This manual is not complete and has no pretension to be so due to lack of time of the contributors – │ │ │ │ │ our first priority is to improve the software. It is worked on continuously, which in some cases might │ │ │ │ │ mean the information is not entirely correct. │ │ │ │ │ Comments on form and content are welcome, please send them to one of the mailing lists (see our │ │ │ │ │ webpage or this section on how to contribute (page 616)), or open an issue on our issue tracker. │ │ │ ├── ./usr/share/doc/gromacs/html/reference-manual/preface.html │ │ │ │ @@ -59,15 +59,15 @@ │ │ │ │

Project leaders: │ │ │ │ Paul Bauer, Berk Hess, Erik Lindahl

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© 1991 – 2000:

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Department of Biophysical Chemistry, University of Groningen. │ │ │ │ Nijenborgh 4, 9747 AG Groningen, The Netherlands.

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© 2001 – 2025:

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© 2001 – 2024:

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The GROMACS development teams at the Royal Institute of Technology and │ │ │ │ Uppsala University, Sweden.

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This manual is not complete and has no pretension to be so due │ │ │ │ to lack of time of the contributors – our first priority is to improve │ │ │ │ the software. It is worked on continuously, │ │ │ │ ├── html2text {} │ │ │ │ │ @@ -31,15 +31,15 @@ │ │ │ │ │ Marklund, Pieter Meulenhoff, Vedran Miletic, Teemu Murtola, Sander Pronk, │ │ │ │ │ Alexey Shvetsov, Alfons Sijbers, Peter Tieleman, Jon Vincent, Teemu Virolainen, │ │ │ │ │ Christian Wennberg, Maarten Wolf │ │ │ │ │ Project leaders: Paul Bauer, Berk Hess, Erik Lindahl │ │ │ │ │ © 1991 – 2000: │ │ │ │ │ Department of Biophysical Chemistry, University of Groningen. │ │ │ │ │ Nijenborgh 4, 9747 AG Groningen, The Netherlands. │ │ │ │ │ -© 2001 – 2025: │ │ │ │ │ +© 2001 – 2024: │ │ │ │ │ The GROMACS development teams at the Royal Institute of Technology │ │ │ │ │ and Uppsala University, Sweden. │ │ │ │ │ This manual is not complete and has no pretension to be so due to lack of time │ │ │ │ │ of the contributors – our first priority is to improve the software. It is │ │ │ │ │ worked on continuously, which in some cases might mean the information is not │ │ │ │ │ entirely correct. │ │ │ │ │ Comments on form and content are welcome, please send them to one of the │ │ │ ├── ./usr/share/doc/gromacs/html/searchindex.js │ │ │ │ ├── js-beautify {} │ │ │ │ │ @@ -822,15 +822,15 @@ │ │ │ │ │ "ftp": [0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 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